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[波函数分析求助] 能否通过RDG分析,解释异构体稳定性的差异

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本帖最后由 IIIO_OIII 于 2021-5-5 13:56 编辑

我有两个同分异构体,用wB97XD/6-311G**优化并算得他们气象条件下的自由能。A比B更稳定,差3.5kcal/mol。随后为了分析稳定性差异的原因和计算分子内氢键的强度,用B3LYP-D3(BJ)/ma-TZVPP做了单点能计算,并用单点能计算的fchk文件得到了各自氢键BCP处的电子密度,生成了RDG散点图和RDG(0.5)的等值面图。结果如下:
A分子的等值面图:


A分子的RDG散点图:

B分子的等值面图:

B分子的RDG散点图:

我可以将散点图中的spike和等值面对应起来,分析他们各自分子内有什么样的弱相互作用,也可以用BCP处的电子密度计算得到各个分子内氢键的强度。两个分子的氢键键能总和相差很小,所以我无法用分子内氢键强度的不同解释他们稳定性的差异。
另外,我把两个分子的散点图叠到一起进行了比较。

所以在这里请教各位前辈:
1,根据我提供的这些信息,是否有办法通过分析散点图和等值面图,半定性的解释稳定性的差异?是不是需要分析互斥的相互作用?
2,B分子的散点图中,在Sign(λ_2)ρ等于0.04处有一个小spike。而在A分子的散点图中却没有。这个spike我是不是可以理解为B分子中有一个电子密度较大的互斥作用,而A中没有这样的互斥作用。
谢谢各位前辈~


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2#
发表于 Post on 2021-5-6 02:58:26 | 只看该作者 Only view this author
1 A里面有两个蓝色圆片体现两处强内氢键,而B里只有一个强内氢键(虽说B还有略弱的内氢键)。而且A里绿色等值面范围比B明显大很多,范德华吸引作用也更强。所以从直觉上就能判断A的分子内弱相互作用更强。

2 那个根本不是spike。必须戳到底,或者近乎戳到底的才算spike并能纳入讨论。
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