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楼主 Author: sun666
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[GROMACS] 关于伞状采样计算PMF与平均力势积分算自由能的问题

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发表于 Post on 2022-12-28 18:05:12 | 只看该作者 Only view this author
熊小熊 发表于 2022-12-7 20:42
您好,我想请教以下,您的这个问题解决了吗?

指的是△G

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发表于 Post on 2022-12-28 19:41:40 | 只看该作者 Only view this author

好的,谢谢

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发表于 Post on 2023-6-5 09:38:12 | 只看该作者 Only view this author
sun666 发表于 2021-5-23 23:28
谢谢您我看了一下课本总结了一下在两张图上
伞状采样是计算PMF的一种方法,通过PMF可以得到在反应坐标上 ...

您好请问这是那本书上的内容啊,想学习一下

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发表于 Post on 2024-4-6 21:27:51 | 只看该作者 Only view this author
动力学 发表于 2021-9-18 22:08
你好,那PMF曲线指的是自由能G的变化曲线,还是▲G的变化曲线呀。

您好,我想请教以下,您的这个问题解决了吗?

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发表于 Post on 2025-12-15 20:18:06 | 只看该作者 Only view this author
fhh2626 发表于 2021-5-16 17:27
建议你从基础开始学起,一口吃不成胖子

平均力势是一维自由能曲线的同义词

您好,请问一下cp2k输出的shake 因子单位是什么呀,积分后得到的势能面如何转换成 kJ/mol 单位呢?

本版积分规则 Credits rule

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