MOF成功建模，但是优化出问题

Nana

wbn 发表于 2015-12-18 00:13
“多出一个9.2度左右的峰” 从这个描述来看这个结果好象是powder diffraction啊。你做的是crystalline xr ...

恩恩，是的，您说的很对，的确解析晶体结构非常难，我们这边都不太懂结构这方面的东西，我们是生命学院，我们学校里也没有对结构化学较为熟悉的老师，所以就是想根据文献中比较相似的晶体结构，借鉴下结构，说明自己做出的MOF的结构。
最好能够初步模拟下这种结构，就是说明下我们用软件模拟出来的是这种合成出的MOF的一种可能的结构，然后并不是直接就把我们新作出的MOF的新结构就确定下来。
然后我们做出来的是XRD powder diffraction，就是那种曲线的图。我不太明白您说的同心圆的图，我实在是了解的太少了，感谢您一直耐心回复我，实在是太感谢了。

wbn

Nana 发表于 2015-12-18 00:22
恩恩，是的，您说的很对，的确解析晶体结构非常难，我们这边都不太懂结构这方面的东西，我们是生命学院， ...

我对xrd也是一知半解，也没做过mof。我不敢说powder 一定不能解出结构，但是一般新化合物想要分子结构，要在溶液中长出单晶做crystalline diffraction. 还是那句话，你得找专业做xray的人咨询才行。

Nana

wbn 发表于 2015-12-18 00:32
我对xrd也是一知半解，也没做过mof。我不敢说powder 一定不能解出结构，但是一般新化合物想要分子结构， ...

恩恩，再次感谢您的回复，主要是导师不乐意找别人帮忙，他就是希望我能模拟出来，感觉自己愁得头发都掉光了，我再去跟师兄和老师再去谈谈，哈哈，打扰了您一晚上，时间不早了，晚安，祝您好梦。

sobereva

Nana 发表于 2015-12-18 00:11
非常非常感谢sobereva大神的回答，
还有问题想请教您，如果我只是用结构和这个模拟的结构的XRD图是不是 ...

吸附我了解得不多，不过如果你做的时候将MOF的结构冻结住不变，那么就牵扯不到优化，力场没法描述好结构也没关系，只要把MOF和小分子之间的非键相互作用能如实描述即可。

Nana

sobereva 发表于 2015-12-18 00:55
吸附我了解得不多，不过如果你做的时候将MOF的结构冻结住不变，那么就牵扯不到优化，力场没法描述好结 ...

感谢sobereva大神的回复。真是听君一席话胜读十年书。原本我还以为下一步需要非常复杂的优化，然后再进一步作用，现在一下子有了一个明确的方向，非常感谢。