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[CASTEP/Dmol3/MS] 基于DFT密度泛函的地质聚合物酸激发缩合机理研究

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本帖最后由 hcxytpp@163.com 于 2015-12-18 08:42 编辑

想请教一下各位老师,本人想使用MS的Dmol3板块研究——地质聚合物酸激发缩合机理,查文献多是碱激发,基于Sanderson电负性均衡原理计算水解过程中各基团的存在形式,并以此为依据,探究各种可能发生的缩合反应,通过计算比较缩合反应能垒大小来探究可能发生的缩合路径。
本人的实验是酸激发,实验表征发现酸主体元素已构筑到结构中,想用DFT方法——构筑理论模型来验证这一结论,但是不知道怎么着手,特发帖恳请老师指点!不甚感激!
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发表于 Post on 2015-12-17 22:12:35 | 只看该作者 Only view this author
你得这些抽象成理论就是过渡态计算。。。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-12-18 08:36:26 | 只看该作者 Only view this author
非常感谢您的建议!小的还想请教老师一下,是否可以通过直接构筑比较PS PSS PSDS三种骨架结构稳定性和能量来加以阐释可能的构筑形式呢?(可能这样不科学)只是要毕业了,然后 毕业论文内容太少,想加入一些合理的理论计算的数据,可否请老师指点一下,不甚感谢!
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发表于 Post on 2015-12-18 13:57:38 | 只看该作者 Only view this author
hcxytpp@163.com 发表于 2015-12-18 08:36
非常感谢您的建议!小的还想请教老师一下,是否可以通过直接构筑比较PS PSS PSDS三种骨架结构稳定性和能量 ...

可以的,稳定性基本就是DFT和MD的天下。。

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发表于 Post on 2015-12-18 17:05:47 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zyj19831206 于 2015-12-18 17:07 编辑
hcxytpp@163.com 发表于 2015-12-18 08:36
非常感谢您的建议!小的还想请教老师一下,是否可以通过直接构筑比较PS PSS PSDS三种骨架结构稳定性和能量 ...

你首先构筑着三种聚合物的单体,然后使用build polymer构筑起聚合物初始模型,然后需要退火和NPT以及NVT挨个来进行动力学分析,得到现实中认为合适的模型,基本是密度接近就可以了,然后用NVE系综分析数据结果,为啥要用NVE,因为其能量稳定。。。。最终可以得到稳定性和能量值。我觉得验证能量最好还是大数据分析比较好,用MD,你说的dmol3是量子化学,只能研究聚合物单体,不足以说明问题,或者DFT+MD就是dmol3+forcite。。。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-12-18 17:18:43 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 hcxytpp@163.com 于 2015-12-18 17:20 编辑
zyj19831206 发表于 2015-12-18 17:05
你首先构筑着三种聚合物的单体,然后使用build polymer构筑起聚合物初始模型,然后需要退火和NPT以及NVT ...

谢谢老师的悉心指点,只是我仅确定酸骨架元素有参与成键(产物稳定性较未使用酸激发的稳定很多)而已,由于不是晶体结构,所以也没法进行系列表征,自己构筑骨架又不知道酸中骨架原子究竟以什么形式连接与哪个位点,比例是多少,很是困惑,真的只是想多得到一些确定可信的数据增加毕业论文厚度(学校有这个要求)
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发表于 Post on 2015-12-18 17:33:23 | 只看该作者 Only view this author
hcxytpp@163.com 发表于 2015-12-18 17:18
谢谢老师的悉心指点,只是我仅确定酸骨架元素有参与成键(产物稳定性较未使用酸激发的稳定很多)而已,由 ...

你找个类似的结构,只要光谱差不多,大概建立一个模型就可以了,有些时候,模型可以猜测一个,只要表征结果与实验对应。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-12-18 21:27:32 | 只看该作者 Only view this author
zyj19831206 发表于 2015-12-18 17:33
你找个类似的结构,只要光谱差不多,大概建立一个模型就可以了,有些时候,模型可以猜测一个,只要表征结 ...

谢谢老师
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