“第10届量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班将于5月4-8日于北京举办，这是一次性完整、系统学习波函数分析的各种理论知识和全面掌握强大的Multiwfn波函数分析程序使用的最不可错过的机会！请点击此链接查看详情和报名方式，欢迎参加！

“第18届北京科音分子动力学与GROMACS培训班” 将于5月23-26日于北京举办。这是一次性全面、系统学习分子动力学模拟知识和最流行的分子动力学程序GROMACS的关键机会！报名正在进行中，请点击此链接查看详情，欢迎参加！

捐赠本论坛 (Donate this site)
开启辅助访问 切换到宽版

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › plumed做二维metad收敛问题
返回列表 Return 发新帖
Views: 5120|回复 Reply: 0
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[其它程序] plumed做二维metad收敛问题

[复制链接 Copy URL]
sun666

226

帖子

0

威望

881

eV
积分
1107

Level 4 (黑子)
跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
发表于 Post on 2021-8-7 21:46:07 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
各位前辈好
我在使用plumed做二维metad后，其中一个CV并没有在设置的整个区域探索，在达到一定值后不再升高。不知道是因为模拟时间不够长还是势垒太高跨越不过去。我也不确定是否收敛，请前辈指点
cv1与cv2如图一
cv1与时间如图二
cv2与时间如图三
高斯函数高度与时间如图四
cv1与自由能如图五
cv2与自由能如图六
二维自由能图如图七

t-height.png (33.44 KB, 下载次数 Times of downloads: 31)

4:t-height

4:t-height

2维.png (29.87 KB, 下载次数 Times of downloads: 20)

7:二维

7:二维

cv2-free.png (13.8 KB, 下载次数 Times of downloads: 25)

6:t-cv2

6:t-cv2

cv1-free.png (11.17 KB, 下载次数 Times of downloads: 19)

5:t-cv1

5:t-cv1

t-cv2.png (12.33 KB, 下载次数 Times of downloads: 30)

3:t-cv2

3:t-cv2

t-cv1.png (11.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

2:t-cv1

2:t-cv1

cv1与cv2.png (12.43 KB, 下载次数 Times of downloads: 21)

1：cv1-cv2

1：cv1-cv2
回复 Reply

举报 Report

返回列表 Return 发新帖

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-4-24 04:28 , Processed in 0.162447 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list