Multiwfn中非常实用的几何操作和坐标变换功能介绍

Uus/pMeC6H4-/キ

意识到一个问题，给定分子结构后“让某个键平行于某个矢量或某个笛卡尔轴”实际上并没有唯一确定最终的取向，因为还有绕该矢量/笛卡尔坐标轴旋转的任意角度，比如水分子让一根O-H键朝x轴的话整个分子仍可能在xOy平面或者xOz平面上。所以我想小小建议两个新功能：

1. 类似子功能5的扩展，输入三个原子序号（检查非数值上共线）与一个笛卡尔平面（如xOy或xOz），输出旋转的结构，使得前两个原子连线平行于笛卡尔平面的第一个轴（对xOy或xOz而言是x轴），并且三个原子所在平面与笛卡尔平面平行；
2. 类似子功能8的扩展，输入一批原子的序号与两个笛卡尔轴，输出旋转的结构，使得除转动惯量最小的主轴平行于第一个笛卡尔轴外，还让转动惯量最大的主轴平行于第二个笛卡尔轴。