怎么从hole生成的.sph文件和.txt文件中得到孔的三维坐标？

金水河的春天 · 发表于 Post on 2021-8-30 09:24:51

您好！

用hole软件处理一个离子通道蛋白，得到一个.sph文件和一个.txt文件，想从文件中得到通道的三维坐标。
想问一下.txt文件第一列cenxyz.cvec数据是代表孔道的z轴坐标吗？
这2个文件中的每列数据代表什么意思？
怎么从这两个文件中得到通道的三维坐标？有可以帮助获得坐标的脚本吗？
2个文件的数据如下图：

guoxiaomeng · 发表于 Post on 2023-10-17 16:59:41

您好，请问您是怎么得到坐标的呢

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[综合交流] 怎么从hole生成的.sph文件和.txt文件中得到孔的三维坐标？