计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 6429|回复 Reply: 9
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Material Studio] 怎么用MS对MOF所有单元相同位置的氢替换成氯原子

[复制链接 Copy URL]

6

帖子

0

威望

47

eV
积分
53

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
   老师您好,我想在MS中对一个现有的MOF结构进行改性,比如图片中左边是MOF的结构单元,怎么把所有结构单元中的相同位置的一个氢替换成一个氯原子。因为有对称性,通常改变一个氢,所有的氢都会改变。取消对称性的话,自己手动替换,感觉自己修改的有问题。请问各位老师,应该怎么对MOF建模。

QQ图片20210830215919.png (72.43 KB, 下载次数 Times of downloads: 28)

MOF结构单元

MOF结构单元

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125153

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2021-8-31 14:08:05 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“MS对MOF建模”改了,以后务必注意
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

62

帖子

0

威望

1663

eV
积分
1725

Level 5 (御坂)

3#
发表于 Post on 2021-9-6 10:31:03 | 只看该作者 Only view this author
根据你的描述,应该是需要降低对称性来进行这种操作,不知道你的具体体系是什么对称性,可能需要多尝试几次

6

帖子

0

威望

47

eV
积分
53

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-7 18:26:48 | 只看该作者 Only view this author
玉米猫 发表于 2021-9-6 10:31
根据你的描述,应该是需要降低对称性来进行这种操作,不知道你的具体体系是什么对称性,可能需要多尝试几次

你好,这个MOF材料是ZIF-68,对称性是P63/MMC ,请问应该怎么降低对称性?谢谢

62

帖子

0

威望

1663

eV
积分
1725

Level 5 (御坂)

5#
发表于 Post on 2021-9-7 18:49:30 | 只看该作者 Only view this author
ForLei 发表于 2021-9-7 18:26
你好,这个MOF材料是ZIF-68,对称性是P63/MMC ,请问应该怎么降低对称性?谢谢

可以上传一下CIF文件吗?

6

帖子

0

威望

47

eV
积分
53

Level 2 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-8 15:21:37 | 只看该作者 Only view this author
玉米猫 发表于 2021-9-7 18:49
可以上传一下CIF文件吗?

我上传文件有问题,我用网盘吧。   ZIF-68   https://pan.baidu.com/s/1DFZP_MyDw8RGe7ScY5D5ig    提取码:731v

62

帖子

0

威望

1663

eV
积分
1725

Level 5 (御坂)

7#
发表于 Post on 2021-9-8 19:35:43 | 只看该作者 Only view this author
ForLei 发表于 2021-9-8 15:21
我上传文件有问题,我用网盘吧。   ZIF-68   https://pan.baidu.com/s/1DFZP_MyDw8RGe7ScY5D5ig    提取 ...

你看一下这样行不行

ZIF-68-Cl.cif

11.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 10

6

帖子

0

威望

47

eV
积分
53

Level 2 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-9 10:47:45 | 只看该作者 Only view this author
玉米猫 发表于 2021-9-8 19:35
你看一下这样行不行

行,太感谢了,这个就是我想弄的,请问这个应该怎么操作,方便加您的联系方式吗,我微信18803206403

6

帖子

0

威望

47

eV
积分
53

Level 2 能力者

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-9 10:51:35 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ForLei 于 2021-9-10 09:09 编辑
玉米猫 发表于 2021-9-8 19:35
你看一下这样行不行


6

帖子

0

威望

47

eV
积分
53

Level 2 能力者

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-21 14:38:44 | 只看该作者 Only view this author
玉米猫 发表于 2021-9-8 19:35
你看一下这样行不行

你好,能问下您的联系方式吗,想询问一下通过什么依据来改变MOF的对称性,替换原子

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-24 02:53 , Processed in 0.169588 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list