使用intel全家桶编译cp2k8.2

PoorChaos · 发表于 Post on 2021-11-6 23:37:15

本帖最后由 PoorChaos 于 2021-11-7 00:03 编辑

我想用你的方法重新编译CP2K
看您说注释，不会用注释命令，可否举例说明？谢谢
另外按照老师的办法ORCA安装了openMPI，这样就会冲突

我把source /home/xxx/intel/oneapi/setvars.sh 加进去再运行CP2K 出现如下错误
MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD
with errorcode 1.

NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.
You may or may not see output from other processes, depending on
exactly when Open MPI kills them.

但是加进去以后测试CP2K变成77秒，删除source /home/xxx/intel/oneapi/setvars.sh 测试时间就恢复到7秒了

PoorChaos · 发表于 Post on 2021-11-7 16:27:17

PoorChaos 发表于 2021-11-6 23:37
我想用你的方法重新编译CP2K
看您说注释，不会用注释命令，可否举例说明？谢谢
另外按照老师的办法ORCA安 ...

请教了sob老师，还是建议用openmpi编译CP2K

丁越 · 发表于 Post on 2021-11-8 09:29:41

本帖最后由丁越于 2021-11-8 09:32 编辑

PoorChaos 发表于 2021-11-6 23:37
我想用你的方法重新编译CP2K
看您说注释，不会用注释命令，可否举例说明？谢谢
另外按照老师的办法ORCA安 ...

运行cp2k时，.bashrc下intelmpi和openmpi只能存在一个，即你要么是用基于intelmpi的cp2k，就把基于openmpi的cp2k的路径给注释了。目前来说我个人觉得还是用openmpi好，intel全家桶编译出来的没有psmp版本（popt），ssmp运行好多时候不如popt的

PoorChaos · 发表于 Post on 2021-11-8 09:36:48

丁越发表于 2021-11-8 09:29
运行cp2k时，.bashrc下intelmpi和openmpi只能存在一个，即你要么是用基于intelmpi的cp2k，就把基于openmp ...

是的,我又重新用openmpi了,
但是请问一下,注释是怎么注释的,
在开头行加#就可以了吗?
比如
#
source /home/feng/cp2k-8.2/tools/toolchain/install/setup

还是#source /home/feng/cp2k-8.2/tools/toolchain/install/setup

丁越 · 发表于 Post on 2021-11-8 09:51:59

PoorChaos 发表于 2021-11-8 09:36
是的,我又重新用openmpi了,
但是请问一下,注释是怎么注释的,
在开头行加#就可以了吗?

#source /home/feng/cp2k-8.2/tools/toolchain/install/setup是正确的，#哪一行就代表注释哪一行，抽空多看看《鸟哥的linux私房菜》，linux的基本运行常识必须得掌握。

PoorChaos · 发表于 Post on 2021-11-8 09:58:24

丁越发表于 2021-11-8 09:51
#source /home/feng/cp2k-8.2/tools/toolchain/install/setup是正确的，#哪一行就代表注释哪一行，抽空多 ...

谢谢正在看,打算买纸质

看到隔壁说是动态管理哪个环境加载哪个环境
http://bbs.keinsci.com/thread-24999-1-1.html

丁越 · 发表于 Post on 2021-11-8 10:01:13

PoorChaos 发表于 2021-11-8 09:58
谢谢正在看,打算买纸质
看到隔壁说是动态管理哪个环境加载哪个环境
http://bbs.keinsci.com/threa ...

个人服务器就没必要使用module模块化管理了，但是集群得用。easybuild比较好用。

PoorChaos · 发表于 Post on 2021-11-8 10:12:40

丁越发表于 2021-11-8 10:01
个人服务器就没必要使用module模块化管理了，但是集群得用。easybuild比较好用。

好我摸索一下怎么用easybuild

丁越 · 发表于 Post on 2021-11-8 10:33:07

PoorChaos 发表于 2021-11-8 10:12
好我摸索一下怎么用easybuild

如果懒得自己编译easybuild的话，yum直接下载module这个软件也行，也可以实现module模块化管理。

PoorChaos · 发表于 Post on 2021-11-8 10:42:08

丁越发表于 2021-11-8 10:33
如果懒得自己编译easybuild的话，yum直接下载module这个软件也行，也可以实现module模块化管理。

完全不会啊，新手
我慢慢摸索

planet5460 · 发表于 Post on 2022-3-8 03:11:28

djjj148 发表于 2021-9-12 09:11
我用楼主的方法编译出了psmp，gcc-8.3.0,intel2018u4，速度很快，甚至比intel编译的7.1还快一点点。
对于 ...

楼主，2018u4，能不能共享一份呢，谢谢

planet5460 · 发表于 Post on 2022-3-8 03:13:15

akakcolin 发表于 2021-9-12 12:19
既然楼主都用oneapi构建整个编译环境，我一般默认剩下的源程序的build 都用intel的，这有个路径依赖的惯 ...

楼主，能不能共享下你用one编译的全过程，非常感谢

zhukangg · 发表于 Post on 2022-5-9 17:08:02

akakcolin 发表于 2021-9-12 11:31
跑长时间内存增加一般就是程序内存泄露，是intel有些版本的mpi有bug，之前曾遇到2019编译的有问题，换 ...

那请问哪个版本的Intelmpi解决了这个问题呢？2019.updat1或者2020，2021可以吗

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[CP2K] 使用intel全家桶编译cp2k8.2