amber14或amber18里面的pmemd要收费吗？

尘劫 · 发表于 Post on 2021-10-11 09:42:33

最近准备用amber计算材料的自由能，安装了amber和ambertool的14版本和18版本。看教程，计算自由能的时候需要用到sander.mpi和pmemd.mpi模块。我知道sander.mpi模块是在Ambertool里面的不收费，但是pmemd.mpi我不确定在哪个里面的，我看sob社长给的amber14安装教程里面说pmemd板块好像是在amber里面的，不知道18版的pmemd是不是也在amber里面。所以想确定一下使用pmemd是不是要收费，如果是的话再考虑考虑。

fhh2626 · 发表于 Post on 2021-10-11 09:48:21

Amber主程序只包含pmemd，当然要收费

喵星大佬 · 发表于 Post on 2021-10-11 10:23:32

计算材料的自由能你用lammps不就好了，支持的好的多

牧生 · 发表于 Post on 2021-10-11 10:52:55

本帖最后由牧生于 2021-10-11 10:54 编辑

为何不上amber官网去瞧瞧最后这一段话

http://ambermd.org/GetAmber.php

Fee Waivers
Waivers for the license fee are available for scientists outside of North America, Western Europe and Japan. Please send email to dacase.ambermd@gmail.com, explaining your situation, and your need for the pmemd program (all other parts of Amber are available for free).

尘劫 · 发表于 Post on 2021-10-11 13:44:06

fhh2626 发表于 2021-10-11 09:48
Amber主程序只包含pmemd，当然要收费

好的，谢谢回复

尘劫 · 发表于 Post on 2021-10-11 13:45:06

牧生发表于 2021-10-11 10:52
为何不上amber官网去瞧瞧最后这一段话

http://ambermd.org/GetAmber.php

好的，谢谢，刚开始用amber，先看的中文网站，我去瞧瞧这个

尘劫 · 发表于 Post on 2021-10-11 13:46:04

喵星大佬发表于 2021-10-11 10:23
计算材料的自由能你用lammps不就好了，支持的好的多

lammps也能算吗？我想算一个材料的溶剂化自由能，我以为lammps算不了，就没看了。

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