求助：Multiwfn结合VMD绘制静电势，VMD报错退出问题

Trivers · 发表于 Post on 2021-10-12 00:24:32

本帖最后由 Trivers 于 2021-10-12 17:05 编辑

请教各位大神：
   我学习了博文使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示）（http://sobereva.com/443）之后，尝试用Multiwfn结合VMD作图时，Multiwfn生成vtx1.pdb，mol1.pbd，surfanalysis.pdb, 等文件都是正常的，但是，在VMD里输入pt命令之后，运行到如截图所示的步骤之后就会自动退出，请问是什么原因造成的，应该如何解决呢？
   注：
   使用的Multiwfn版本为Multiwfn_3.8_dev_bin_Win64，VMD版本为1.93.，且在vmd.rc的末尾已经输入了博文中提到的代码，如下所示。
proc iso {} {source ESPiso.vmd}
proc iso2 {} {source ESPiso2.vmd}
proc pt {} {source ESPpt.vmd}
proc pt2 {} {source ESPpt2.vmd}
proc ext {} {source ESPext.vmd}

sobereva · 发表于 Post on 2021-10-12 03:42:11

把vtx1.pdb，mol1.pdb，surfanalysis.pdb压缩后上传

Trivers · 发表于 Post on 2021-10-12 17:06:22

sobereva 发表于 2021-10-12 03:42
把vtx1.pdb，mol1.pdb，surfanalysis.pdb压缩后上传

Sob老师，相关文件已上传，请查阅，谢谢！

sobereva · 发表于 Post on 2021-10-13 02:59:46

估计是vtx1.pdb太大再加上VMD有些bug所致。是否能正常载入有一定随机性，我用VMD 1.9.3 32bit，第一次输入pt也出现了崩溃问题，不过第二次启动VMD再输入pt就能正常载入了。建议你多试几次，应该能有一次成功。

Trivers · 发表于 Post on 2021-10-13 17:34:33

谢谢sob老师，这个体系是一个二聚体，我试了多次之后还是无法正常显示静电势。我换了一个小一点的体系之后，发现是可以正常显示静电势的。所以应该还是我电脑配置的问题吧，我再想想其他办法，再次谢谢您！

lyj714 · 发表于 Post on 2021-10-13 18:22:30

我个人认为是官网那个VMD对于windows只是32位的缘故。我用我编译的64位的vmd1.9.3没任何问题：
http://bbs.keinsci.com/thread-23119-1-1.html

Trivers · 发表于 Post on 2021-10-13 20:17:49

lyj714 发表于 2021-10-13 18:22
我个人认为是官网那个VMD对于windows只是32位的缘故。我用我编译的64位的vmd1.9.3没任何问题：
http://bbs ...

谢谢大神！从您提供帖子里下载64位VMD并安装之后，可以成功打开这个二聚体的静电势图了！

哈库呐玛塔塔 · 发表于 Post on 2022-10-24 16:49:01

本帖最后由哈库呐玛塔塔于 2022-10-24 16:50 编辑

老师，我想请问，我先用Multiwfn计算了分子的静电势得到了两个cub文件，分别是density.cub和totesp.cub文件，然后将这两个cub文件复制到vmd文件下，但是打开vmd时，输入source ESP.vmd时，无法识别这两个cub文件，请问是怎么回事？

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