cp2k做振动分析生成的.mol文件放入Multiwfn后出现错误

Akaiconan · 发表于 Post on 2021-10-12 20:08:43

社长和各位同仁好！本人利用cp2k对一个几十个原子的体系做振动分析，得到了一个名字.格式为xxx.mol文件。在将其导入Multiwfn的过程中，出现了报错，恳请各位帮忙看一下问题所在。
导入Multiwfn的错误信息如下（节选）：
Input file path, for example E:\Real_world\Kanan.wfn
(Supported: .mwfn/wfn/wfx/fch/molden/31/chg/pdb/xyz/mol/mol2/cub/grd, etc.)
Hint: Press ENTER button directly can select file in a GUI window. To reload the file last time used, simply input the letter "o". Input such as ?miku.fch can open the miku.fch in the same folder as the file last time used.

Selected file: /Akaiconan/a1-vs-VIBRATIONS-1.mol
Please wait...
forrtl: severe (64): input conversion error, unit 10, file /Akaiconan/a1-vs-VIBRATIONS-1.mol
Image             PC             Routine          Line       Source
Multiwfn          0000000001F21F4B  Unknown             Unknown  Unknown
Multiwfn          0000000001F527F0  Unknown             Unknown  Unknown
Multiwfn          0000000001F504D3  Unknown             Unknown  Unknown
Multiwfn          000000000071145F  Unknown             Unknown  Unknown
Multiwfn          00000000006DB816  Unknown             Unknown  Unknown
Multiwfn          00000000007F709E  Unknown             Unknown  Unknown
Multiwfn          0000000000430E22  Unknown             Unknown  Unknown
libc-2.28.so    000014D626A83493  __libc_start_main    Unknown  Unknown
Multiwfn          0000000000430D29  Unknown             Unknown  Unknown

社长在教如何利用Multiwfn生成cp2k输入文件时，有说过.mol文件可以用molden观看，可是我在window上和linux上装molden均失败了，所以才来此询问。

a1-vs-VIBRATIONS-1.mol (250.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 11) 此为振动分析得到的结果文件

sobereva · 发表于 Post on 2021-10-12 20:22:08

这是molden文件，不是mol文件，完全是两码事，显然不可能让Multiwfn以mol文件的格式去读molden文件
另外，记录振动模式的molden文件不是一般意义的molden文件，至少你不可能Multiwfn看里面的振动模式，Multiwfn也没法基于这样的文件做波函数分析

tuzhidingdong · 发表于 Post on 2021-10-17 18:35:28

.MOl里面有光谱信息，可以直接拿来绘图

丁越 · 发表于 Post on 2021-10-17 22:22:30

本帖最后由丁越于 2021-10-17 22:30 编辑

win 下的molden解压后里面有个gmolden.exe, 打开用就行
我个人感觉molden这个程序界面做的很垃圾，而且文件下拉菜单莫名其妙会最小化，有时候差点找不到。。。不知道有什么其他的程序可以代替一下这个软件看cp2k的振动分析文件

Akaiconan · 发表于 Post on 2021-11-16 09:29:57

tuzhidingdong 发表于 2021-10-17 18:35
.MOl里面有光谱信息，可以直接拿来绘图

非常感谢，我去试试

Akaiconan · 发表于 Post on 2021-11-16 09:30:54

丁越发表于 2021-10-17 22:22
win 下的molden解压后里面有个gmolden.exe, 打开用就行
我个人感觉molden这个程序界面做的很垃圾，而且文 ...

非常感谢，molden我总是装不上，可能是以前装其它的软件给安装环境破坏了。

yjb · 发表于 Post on 2023-1-5 14:54:17

丁越发表于 2021-10-17 22:22
win 下的molden解压后里面有个gmolden.exe, 打开用就行
我个人感觉molden这个程序界面做的很垃圾，而且文 ...

您好，我在win下打开gmolden.exe之后，不知道怎么把算好的振动文件导入。应该怎么办呢？

丁越 · 发表于 Post on 2023-1-5 21:10:05

yjb 发表于 2023-1-5 14:54
您好，我在win下打开gmolden.exe之后，不知道怎么把算好的振动文件导入。应该怎么办呢？

我已经抛弃这个东西了，乱七八糟奇奇怪怪的图标让你摸不着头脑。

用http://bbs.keinsci.com/thread-28305-1-1.html 或者jmol打开

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