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[综合交流] 为什么three-body potential or many-body potential计算比较耗时,有什么难度?

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为什么three-body potential or many-body potential计算比较耗时,有什么难度?

能不能从计算量,算法各个角度给我解释下,不大清楚!

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发表于 Post on 2021-10-25 15:44:44 | 只看该作者 Only view this author
n-body potential的计算量和体系大小的n次方成正比(由n-body potential的定义即可看出这一点),所以n越大越耗时。如果不说n,n默认等于2,所以你说的这些n>=3的情况比n不写出来的情况更加耗时
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-25 16:55:07 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-10-25 15:44
n-body potential的计算量和体系大小的n次方成正比(由n-body potential的定义即可看出这一点),所以n越大 ...

这个与N成正比,有没有具体的参考资料?可以分享给我看看嘛?!

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发表于 Post on 2021-10-25 17:22:25 | 只看该作者 Only view this author
ibookgoo 发表于 2021-10-25 09:55
这个与N成正比,有没有具体的参考资料?可以分享给我看看嘛?!

我说了,看定义就知道了。从n-body potential的定义式推出计算量与体系大小的n次方成正比(注意不是和n成正比),只需要最基础的算法知识,因此一般教材或者文献不会替你推导。
就好比我告诉你12345+54321=66666,你问我有没有参考资料,我只能推荐给你小学数学课本,让你自己学怎么做多位数加法,而不可能去找一本真的写了12345+54321=66666的课本给你看。
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-10-25 17:59:00 | 只看该作者 Only view this author
ibookgoo 发表于 2021-10-25 16:55
这个与N成正比,有没有具体的参考资料?可以分享给我看看嘛?!

你想想为什么用对势的时候非键作用计算耗时和N^2成正比,举一反三不就知道了。如果甚至连这都不懂,随便google点最基本的力场介绍资料,或者看点最基本的讲分子模拟的书,诸如Molecular modelling Principles and applications(Leach A.R.,2ed,2001)。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-10-25 18:05:31 | 只看该作者 Only view this author
在有X个粒子的体系中计算n体势,至少要算 次能量和受力,这明摆着的高中小盆友都能理解的问题
一般对势n=2,三体势的时候n=3,当x非常大的时候这两个谁大不是明摆着的么



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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-26 14:48:37 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-10-25 17:22
我说了,看定义就知道了。从n-body potential的定义式推出计算量与体系大小的n次方成正比(注意不是和n成 ...

OK,谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-26 14:49:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-10-25 17:59
你想想为什么用对势的时候非键作用计算耗时和N^2成正比,举一反三不就知道了。如果甚至连这都不懂,随便g ...

OK,谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-26 14:50:34 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2021-10-25 18:05
在有X个粒子的体系中计算n体势,至少要算次能量和受力,这明摆着的高中小盆友都能理解的问题
一般对势n=2 ...

OK,谢谢

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