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[CP2K] 关于cp2k-8.2.ssmp版本在本地工作站上核数调用问题

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本帖最后由 nusiew 于 2021-11-7 20:50 编辑

大家好,课题组的服务器有2个物理cpu,每个物理cpu上有20个核,每个核的超线程数为2,总逻辑cpu数是80。请教大家cp2k-8.2.ssmp版本在该工作站上能调用的核数是40个吗?可以用命令控制调用的核数吗?因为跑200个Si原子的AIMD,电子步大概在3-4秒,感觉速度有点慢,所以来问问大家是不是哪里出问题了。下面是各个版本的比较。谢谢大家!


两个对易的厄米算子可以有共同本征函数集

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发表于 Post on 2021-11-7 21:22:22 | 只看该作者 Only view this author
【CP2K v8.2.0 MPI并行版安装 无需root授权-哔哩哔哩】https://b23.tv/QaKQXG

试试这个版本。
另,你肯定没有仔细看cp2k官方的说明文档。
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发表于 Post on 2021-11-8 22:33:30 | 只看该作者 Only view this author
你的情况最多只适合调用40个核

ssmp的并行核数由OMP_NUM_THREADS环境变量指定。
建议你还是用popt版,否则有些任务会很浪费CPU计算能力
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-9 08:43:40 | 只看该作者 Only view this author
jitou11 发表于 2021-11-8 16:44
你跑cp2k用的什么命令?

cp2k name.inp  |tee name.out
两个对易的厄米算子可以有共同本征函数集

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-9 08:45:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-11-8 22:33
你的情况最多只适合调用40个核

ssmp的并行核数由OMP_NUM_THREADS环境变量指定。

谢谢解答,ssmp的并行核数是不是不能自己指定,软件会自动调用最大核数?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-9 08:45:21 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2021-11-7 21:22
【CP2K v8.2.0 MPI并行版安装 无需root授权-哔哩哔哩】https://b23.tv/QaKQXG

试试这个版本。

好的,谢谢
两个对易的厄米算子可以有共同本征函数集

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发表于 Post on 2021-11-10 01:56:47 | 只看该作者 Only view this author
nusiew 发表于 2021-11-9 08:45
谢谢解答,ssmp的并行核数是不是不能自己指定,软件会自动调用最大核数?

你设OMP_NUM_THREADS不就完了
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