gromacs：em之后最后一组材料会散开

王珑霏 · 发表于 Post on 2021-12-8 11:02:42

本帖最后由王珑霏于 2021-12-14 11:08 编辑

为什么在跑完em以后，如果不把材料冻住的话，最后一组材料会散开呢，一共使用了四组材料，前三组只是发生了变形变化，但是最后一组会跟图片里一样散开，图片中的材料为石墨烯

Entropy.S.I · 发表于 Post on 2021-12-8 11:20:28

使用了半各向同性控压，未对X/Y方向执行压力耦合。提取pres_zz或许能达到期望的1bar压强。
猜测你这是界面体系，界面平行于XY平面，由于界面张力，X/Y方向的压力张量分量很负，导致总压很负，这是正常现象，再模拟久一些就可以用这些压力数据计算界面张力

王珑霏 · 发表于 Post on 2021-12-15 08:57:17

Entropy.S.I 发表于 2021-12-8 11:20
使用了半各向同性控压，未对X/Y方向执行压力耦合。提取pres_zz或许能达到期望的1bar压强。
猜测你这是界面 ...

谢谢您的答复！

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