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[Multiwfn使用咨询] 请问sob老师两个问题(静电势相关)

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看文献时,发现了下面这个图(MEP:molecular electrostatic potential),文献中是计算有机分子同graphene和BN之间的作用,对此图的解释为“The molecular charge distribution remains unperturbed by the interaction between the sheet and the amino acid, but the merging of the charge clouds of the adsorbate and the adsorbent is indicative of affinity of the sheet towards the amino acids. The result reinforces the fact that amino acids get physically adsorbed on the nano-surface and this works in favour of the suitability of the nanosheets ”

首先,请问用Multiwfn如何得到这种MEP图?
第二,从这个图如何才能看出来“charge distribution unperturbed”?有标准吗?

谢谢sob老师。

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发表于 Post on 2016-2-19 18:47:42 | 只看该作者 Only view this author
图呢?
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-2-19 20:36:41 | 只看该作者 Only view this author
这个图,不好意思,刚才没发上来。感觉挺好看的,在您的作品中很多都有类似的2D/3D的图片,感觉可以增加文章的效果。

IMG_20160219_173252.jpg (418.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 46)

IMG_20160219_173252.jpg

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发表于 Post on 2016-2-19 21:26:09 | 只看该作者 Only view this author
1 在GaussView里绘制分子表面静电势填色图的过程
http://sobereva.com/253
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布
http://sobereva.com/196

2 对比分子独立状态MEP分布与形成复合物之后那个分子附近的MEP分布,差别不大就算unperturbed
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-2-20 02:07:02 | 只看该作者 Only view this author
慢慢感觉sob,确实是神一样的存在!
我真心祝愿你身体一直健康,无私精神永不懈怠!
这样,我们都有福了。谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-2-20 10:39:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-2-19 21:26
1 在GaussView里绘制分子表面静电势填色图的过程
http://sobereva.com/253
使用Multiwfn结合VMD分析和绘 ...

谢谢sob老师。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-2-20 10:41:37 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lastzealot 于 2016-2-20 11:33 编辑
sobereva 发表于 2016-2-19 21:26
1 在GaussView里绘制分子表面静电势填色图的过程
http://sobereva.com/253
使用Multiwfn结合VMD分析和绘 ...

刚才看着您的教程已经能做出MEP图了。
请问这个MEP静电等值面图一般用来做什么呢?可以说明哪些问题呢?
谢谢sob老师。

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发表于 Post on 2016-2-20 12:20:11 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2016-2-20 10:41
刚才看着您的教程已经能做出MEP图了。
请问这个MEP静电等值面图一般用来做什么呢?可以说明哪些问题呢? ...

看这些
静电势与平均局部离子化能综述合集
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=219
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-2-20 13:02:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-2-20 12:20
看这些
静电势与平均局部离子化能综述合集
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=219

谢谢老师
太给力了

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发表于 Post on 2016-2-20 13:24:30 | 只看该作者 Only view this author
luwis 发表于 2016-2-20 02:07
慢慢感觉sob,确实是神一样的存在!
我真心祝愿你身体一直健康,无私精神永不懈怠!
这样,我们都有福了 ...

我也感觉是,sob老师在,心里感觉很踏实。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-2-20 20:50:23 | 只看该作者 Only view this author
luwis 发表于 2016-2-20 02:07
慢慢感觉sob,确实是神一样的存在!
我真心祝愿你身体一直健康,无私精神永不懈怠!
这样,我们都有福了 ...

神是永远不会生病的。

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