CASTEP或者VASP计算ZnO表面吸附DNT分子（N,N-二硝基甲苯）

lwj

卡开发发 发表于 2016-10-25 19:50
无关，磁性结构一般可能都存在这种情况。其实不做调整原则上通过修改density mixing也能够做出来，就是要 ...

我就是听您的键density mixing的charge调小了才收敛的，也就是说初始值影响变小了，这对结果影响大吗？另外您的意思是真空层要大于20A吗？

卡开发发

lwj 发表于 2016-10-26 09:37
我就是听您的键density mixing的charge调小了才收敛的，也就是说初始值影响变小了，这对结果影响大吗？另 ...

density mixing的减小不会影响结果，只是一种数值方法而已，这个与初值问题无关。真空层可以取得充分大来消除吸附分子和上表面的相互作用，同时需要进行偶极矩修正。

lwj

卡开发发 发表于 2016-10-26 20:02
density mixing的减小不会影响结果，只是一种数值方法而已，这个与初值问题无关。真空层可以取得充分大来 ...

我又试了减小density mixing的charge而不调整表面原子，结果能收敛，有一个结果还正常，但是有几个相近表面结构和bulk模型的变化不到千分之一，不知道是不是软件的问题，我本地算一下试试。

lwj

卡开发发 发表于 2016-10-26 20:02
density mixing的减小不会影响结果，只是一种数值方法而已，这个与初值问题无关。真空层可以取得充分大来 ...

老师，您好，请问如果周期性体系中吸附的原子到盒子外面去了影响大吗？或者说是不是应该换个大的体系计算？

卡开发发

lwj 发表于 2016-12-1 11:11
老师，您好，请问如果周期性体系中吸附的原子到盒子外面去了影响大吗？或者说是不是应该换个大的体系计算 ...

不大，只是显示问题，可以通过平移格子的边界来解决这个问题。但是，如果吸附的分子和相邻晶格吸附的分子距离很短，就得换更大的晶格，你可以建立超胞测量一下。

lwj

卡开发发 发表于 2016-12-1 15:45
不大，只是显示问题，可以通过平移格子的边界来解决这个问题。但是，如果吸附的分子和相邻晶格吸附的分子 ...

谢谢您，我测了一下间距，H、O间距为2.453A，应该存在较强的H键作用，看来我计算用的表面有点小。

lwj

卡开发发 发表于 2016-12-1 15:45
不大，只是显示问题，可以通过平移格子的边界来解决这个问题。但是，如果吸附的分子和相邻晶格吸附的分子 ...

老师，您好，我建立超胞计算过渡态，吸附密度会降低，是否需要对以前计算的单个CO2分子吸附进行重新计算？

卡开发发

lwj 发表于 2016-12-1 17:08
老师，您好，我建立超胞计算过渡态，吸附密度会降低，是否需要对以前计算的单个CO2分子吸附进行重新计算 ...

覆盖度变了，所以吸附计算肯定也得重新做。当然，我也不能排除反应能在高覆盖度情形下进行。

lwj

卡开发发 发表于 2016-12-1 20:54
覆盖度变了，所以吸附计算肯定也得重新做。当然，我也不能排除反应能在高覆盖度情形下进行。

我正在算，如果吸附能变化不大，有的反应能变化应该也不大。谢谢您了