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[GROMACS] gmx densmap和gmx xpm2ps作图求助

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本帖最后由 landian666 于 2022-1-25 15:49 编辑

先用gmx_mpi densmap -f step5.xtc -s step5.tpr -n index.ndx -o densmap.xpm -b 30000 -aver z -xmin 9.2 -xmax 9.6 得到.xpm文件
然后用gmx_mpi xpm2ps -f densmap.xpm -o densmap.eps -rainbow blue得到下图
想请教两个问题:
1、如何调整图片横纵坐标的显示数量,目前来看坐标全都重叠到了一起 (曾尝试用-di para.m2p控制坐标数量,没有成功)
2、如何任意编辑eps文件,比如更改底色,调整图例颜色的上下限等

谢谢~~~

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发表于 Post on 2022-1-26 02:06:38 | 只看该作者 Only view this author
论坛里有人发布过一个比xpm2ps更好的工具你可以试试http://bbs.keinsci.com/thread-20056-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-29 11:55:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-1-26 02:06
论坛里有人发布过一个比xpm2ps更好的工具你可以试试http://bbs.keinsci.com/thread-20056-1-1.html

非常感谢~~

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发表于 Post on 2023-4-12 15:17:15 | 只看该作者 Only view this author

请问大佬会了吗?

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发表于 Post on 2023-6-12 14:51:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-1-26 02:06
论坛里有人发布过一个比xpm2ps更好的工具你可以试试http://bbs.keinsci.com/thread-20056-1-1.html

老师,请问怎么下载这个工具呢?

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发表于 Post on 2023-6-13 11:49:30 | 只看该作者 Only view this author
bban007 发表于 2023-6-12 14:51
老师,请问怎么下载这个工具呢?

帖子里又不是没提供下载
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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