求助请问Materials studio中的conformers模块可以确定未知的双金属硫化物团簇构型吗

南晓 · 发表于 Post on 2022-2-22 10:26:36

请问Materials studio中的conformers模块可以确定未知的双金属硫化物团簇构型吗

ABetaCarw · 发表于 Post on 2022-2-22 10:53:23

这个模块是基于力场的，我建议你换个别的软件试吧。zhangjun老师的ABCluster你可以试试 https://zhjun-sci.com/software-abcluster-download.php

南晓 · 发表于 Post on 2022-2-22 11:13:32

ABetaCarw 发表于 2022-2-22 10:53
这个模块是基于力场的，我建议你换个别的软件试吧。zhangjun老师的ABCluster你可以试试 https://zhjun-sci. ...

感谢，我是新手不是很明白，还想请问这个模块基于立场不适合确定双金属硫化物团簇吗，这个是因为什么？感谢您指教

sobereva · 发表于 Post on 2022-2-22 11:38:27

南晓发表于 2022-2-22 11:13
感谢，我是新手不是很明白，还想请问这个模块基于立场不适合确定双金属硫化物团簇吗，这个是因为什么？感 ...

M$里没有合适力场干这个事。而且conformer是构象搜索（此物在构象搜索方面也比较烂），你这是团簇构型搜索问题，完全是两码事

这种问题可以用molclus+genmer在GFN-xTB或DFT级别下很容易地做团簇构型搜索
molclus主页
http://www.keinsci.com/research/molclus.html
genmer：生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html

xujc1983 · 发表于 Post on 2022-3-4 10:12:59

就算是有描述双金属硫化物的力场，应该也不可以。
conformers模块本质上就是针对二面角的一系列单点能扫描，找聚合物分子链的构象还可以，找团簇结构显然不合适

南晓 · 发表于 Post on 2022-3-4 16:13:23

xujc1983 发表于 2022-3-4 10:12
就算是有描述双金属硫化物的力场，应该也不可以。
conformers模块本质上就是针对二面角的一系列单点能扫描 ...

好的感谢

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