计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 3217|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合讨论] 求助从电荷密度角度对不同分子的吸附能的分析

[复制链接 Copy URL]

52

帖子

0

威望

257

eV
积分
309

Level 3 能力者

论坛的各位老师好,我最近使用vasp计算了对苯二酚二甲基苯酚两个小分子的吸附能,发现对苯二酚虽然有两个氧原子,理论上吸附作用可能更强,实际计算出的吸附能却高于二甲基苯酚。为了分析原因,我尝试了通过计算bader电荷得到两个分子上的电荷转移结果(如下图),但是仍然无法得到有效的结果,目前正在尝试做吸附末态结构的电荷密度差图,想请教各位老师是否还可以通过何种方法分析是什么作用或者什么基团对吸附的贡献导致两个分子出现了反常的现象?谢谢!

微信图片_20220304135228.png (142.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 23)

微信图片_20220304135228.png

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125131

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2022-3-4 18:28:08 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“从电荷密度角度对吸附能的分析”改了,以后务必注意

这种分子体系极为不适合用VASP,效率很低,功能上限制极大,还没法结合Multiwfn做丰富的波函数分析。应当用Gaussian、ORCA等量子化学程序来算。如果你是指某个固体表面吸附小分子,必须说清楚是什么固体,把截图发出来(最好发二者吸附上去优化后的结构图),否则谁也不知道吸附的机制是什么样。

不要拿Bader电荷(正规名字是AIM电荷)说事,这是非常烂的原子电荷,仔细看
《原子电荷计算方法的对比》(http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml)。讨论静电作用时,应当用对范德华表面静电势描述较好的原子电荷,而AIM电荷在这方面是知名的原子电荷里最烂的。

不要什么时候都拿静电相互作用说事,在非极性表面上色散作用绝对不容忽视,甚至色散作用才是主导,此时拿原子电荷讨论毫无意义,参看下文
18碳环(cyclo[18]carbon)与石墨烯的相互作用:基于簇模型的研究一例
http://sobereva.com/615http://bbs.keinsci.com/thread-25306-1-1.html
谈谈范德华势以及在Multiwfn中的计算、分析和绘制
http://sobereva.com/551http://bbs.keinsci.com/thread-17271-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-20 06:43 , Processed in 0.160984 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list