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楼主 Author: 迷茫的小飞侠
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[新手求助] 高斯l502.exe报错和关于中多种基组的命名

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发表于 Post on 2016-3-16 22:41:44 | 只看该作者 Only view this author
迷茫的小飞侠 发表于 2016-3-16 14:24
谢谢sob老师。
我在模拟的时候使用了#P,但是在Gauss View中并没有得到迭代的能量曲线图。根据Sob写的博 ...

不管是优化正常结束的还是正在优化的输出文件,gaussview在打开文件时,界面的下面有一个选项(默认是不选的),你选上那个就有能量变化曲线了。

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发表于 Post on 2016-3-16 22:57:09 | 只看该作者 Only view this author
迷茫的小飞侠 发表于 2016-3-16 22:24
谢谢sob老师。
我在模拟的时候使用了#P,但是在Gauss View中并没有得到迭代的能量曲线图。根据Sob写的博 ...

gview是显示不了迭代过程中能量曲线图的。自行看输出的SCF每一圈的能量,或者用grep命令批量提取以便观看
scf圈数你增加到100000000000000次也照样收敛不了,迭代100年也收敛不了。
修改收敛限到SCF=conver=6对单点可以接受,对几优化不要修改
没有万能的解决不收敛的办法,必须原理上搞懂博文中提到的不同解决方式,反复尝试。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-16 23:01:45 | 只看该作者 Only view this author
bomsaude 发表于 2016-3-16 22:41
不管是优化正常结束的还是正在优化的输出文件,gaussview在打开文件时,界面的下面有一个选项(默认是不 ...

我知道这个,我选择了 但是没有显示. 我看了输出文件,但也没有找到为什么. 一般我们做了优化以后 如果选择高斯view的open到read intermediate geometries的方式打开log文件:在查看时应该是会看到迭代能量曲线以及优化的每一步对应的结果,但是现在不仅迭代能量曲线没有 而且打开后的log文件也有对应的优化结果(log文件打开后座上是没有出现)优化步数的.
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-16 23:09:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-16 22:57
gview是显示不了迭代过程中能量曲线图的。自行看输出的SCF每一圈的能量,或者用grep命令批量提取以便观看 ...

恩恩  好的. 因为我对有的原理理解上总是不很确定 理解也不头侧 所以不是太明白Sob老师提到的有些概念. 一般只要正常优化了,我们通过Gview打开计算的log文件后同时选择窗口最下方的”read intermediate geometries“选项,在查看log文件时左上方会有相应的优化步数,而”点击result“的optimization也会出现相应的能量随优化步数增加而变化的趋势图. 此时 这里的能量不是scf的迭代能量. (之前理解错了)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-17 00:12:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-16 22:57
gview是显示不了迭代过程中能量曲线图的。自行看输出的SCF每一圈的能量,或者用grep命令批量提取以便观看 ...

Sob老师,我查看了SCF能量,刚开始基本是在震荡,当圈数是在30-370之间,总体趋势是下降.在370-385之间出现震荡,385-400又开呈下降趋势. 根据这样的数据,我可以得到什么信息呢?通过SCF的迭代能量我能知道是什么原因引起的SCF不收敛吗?在将錒系元素换成Ni以后可以收敛并优化成功,结合Sob老师博文中信息,也就是说在这一个含有錒系元素的优化中 有可能是基组不合适?或者是该结构的HOMO-LUMO能隙较小(在纯晶胞单元中得到的能隙只有0.5eV)
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发表于 Post on 2016-3-17 12:12:38 | 只看该作者 Only view this author
迷茫的小飞侠 发表于 2016-3-17 00:12
Sob老师,我查看了SCF能量,刚开始基本是在震荡,当圈数是在30-370之间,总体趋势是下降.在370-385之间出 ...

就是震荡导致的难收敛
锕系的SDD有大核赝势和小核赝势,如果之前是小核的改成大核试试,其它轻原子也可以换基组试试,也可以换泛函试试(用HF成分高一些的)。各种方法都试试,总比增大迭代次数上限有用得多得多得多得多
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-17 22:14:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-17 12:12
就是震荡导致的难收敛
锕系的SDD有大核赝势和小核赝势,如果之前是小核的改成大核试试,其它轻原子也可 ...

谢谢Sob老师,在不了解大核和小核赝势之前,我做过了大核和小核的测试,两个测试都没有收敛。 昨天重新使用了关键词(根据Sob老师博文修改了关键词) 分别换了泛函和大核赝势,还是报错了,这次报的l301.exe错误。现在正在重新修改
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-4-6 00:48:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-16 21:38
小木虫上看到的解决不收敛的办法一定是坑爹的,只会误人子弟白费时间
怎么解决要看我贴的博文
不会冲 ...

Sob老师关于l502的报错,我将博文中提到的方法都使用到了自己的体系中,查看了SCF的能量 我确定是能量是在在一个特别小的范围内振动,但是结果依旧出现502错误. 如果是初始结构的电子结构不是很好,会不会对优化有影响?
急需Sob老师的指导,谢谢
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发表于 Post on 2016-4-6 12:35:28 | 只看该作者 Only view this author
迷茫的小飞侠 发表于 2016-4-6 00:48
Sob老师关于l502的报错,我将博文中提到的方法都使用到了自己的体系中,查看了SCF的能量 我确定是能量是 ...

优化是优化,SCF是SCF,两个问题不要搅在一起
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-4-20 01:05:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-4-6 12:35
优化是优化,SCF是SCF,两个问题不要搅在一起

谢谢Sob老师,我再好好看看 感觉被自己弄糊涂了.
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