关于伞形采样的参考组的选择问题

xuxu

请问各位老师，我使用gromacs进行伞形采样的时候，pull-geometry=direction，那么我在选择参考组进行固定时，参考组的选择对伞形采样的结果有影响吗？谢谢

Frozen-Penguin

pull是为了获取不同反应坐标的结构，用作伞形采样的初始构象，伞形采样的结果与初始构象的挑选以及伞形采样过程中的约束关系较大，与pull过程中的细节关系不大。