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楼主 Author: Kalinite
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[辅助/分析程序] 基于Gaussian FCHT计算分解重组能和计算Huang-Rhys因子的Python小脚本

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-20 00:01:03 | 只看该作者 Only view this author
wal 发表于 2024-9-19 23:24
老师,我是需要分解重组能的,而且需要对比几个分子的huang-rhys因子,若只讨论相对大小可能不太方便横向 ...

我觉得可以用四点法计算各个分子的重组能,按照Gaussian或FCClasses分解结果的比例,把四点法得到的重组能分配到各个振动模式。虽然这么做可能缺乏理论依据,但确实曾见过有文献这么做,不失为一种办法。

如果基团旋转造成的结构变化很大的话,我估计考虑非谐振的改进也很有限,不过值得一试吧。
Gaussian的FCHT计算有很多关于非谐振的选项,但是手册上写的模棱两可,我没法提供更多帮助了。

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发表于 Post on 2024-9-20 08:39:57 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wal 于 2024-9-20 08:42 编辑
Kalinite 发表于 2024-9-20 00:01
我觉得可以用四点法计算各个分子的重组能,按照Gaussian或FCClasses分解结果的比例,把四点法得到的重组 ...

好的好的,谢谢老师,我再自己琢磨琢磨
老师您有空的话可以告诉我按照总重组能分配结果的文献是哪篇嘛,如果到时候真这么做了可能还要跟导师或是审稿人解释解释

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发表于 Post on 2024-9-20 10:24:06 | 只看该作者 Only view this author
Kalinite 发表于 2024-9-20 00:01
我觉得可以用四点法计算各个分子的重组能,按照Gaussian或FCClasses分解结果的比例,把四点法得到的重组 ...

老师可以分享一下这篇文献吗,我的也是分解重组能和四点法相差太大

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发表于 Post on 2024-10-20 14:38:45 | 只看该作者 Only view this author
老师,您好,我看您上文提到一般用末态结构分解重组能,但是这个荧光发射例子中oldchk用的是始态的chk,这是什么原因呢,是不是对结构不太敏感,谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-25 21:34:49 | 只看该作者 Only view this author
任嘉人amber 发表于 2024-10-20 14:38
老师,您好,我看您上文提到一般用末态结构分解重组能,但是这个荧光发射例子中oldchk用的是始态的chk,这 ...

荧光发射和重组能这两个计算没有关系。
发射计算的是垂直过程,始态和末态没有结构上的区别。

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发表于 Post on 2024-10-28 18:51:47 | 只看该作者 Only view this author
Kalinite 发表于 2024-10-25 21:34
荧光发射和重组能这两个计算没有关系。
发射计算的是垂直过程,始态和末态没有结构上的区别。

好的,谢谢老师

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