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[硬件相关] vasp计算system time过长?

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用 Intel Xeon Platinum 8176搭建了一个服务器,双CPU,共56核。计算一个121个原子的几何优化任务时,OUTCAR输出的时间信息分别为:
                         User time (sec):     2643.744
                          System time (sec):      901.738
                         Elapsed time (sec):     3572.936
正常情况下的  System time (sec)应该很小,请问这可能是什么远远造成的呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-20 10:45:57 | 只看该作者 Only view this author
同时,我发现用一个CPU,也就是28核,计算的时间反而还比56核还少一些,有点费解,请问有老师遇到过这种情况吗?

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发表于 Post on 2022-4-20 18:05:15 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 abin 于 2022-4-20 18:06 编辑

谁告诉你的,核心越多跑得越快呢?

vasp并行线性很好的……
用白话文讲就是,
大概可以认为,12个原子,用12核心,需要一个小时;
那么,36个原子,用36核心,差不多是一个小时……
大概是这个意思……

并不能保证,12个原子体系,
用36个核心,会在20分钟算完。

另外,为保证vasp高效率运行,
需通道全开呀,81系列,需要12个内存条。

以下仅供参考
【迷你集群vasp并行计算-哔哩哔哩】 https://b23.tv/v2Wp8XQ
【加速vasp并行计算,提速高达34倍!!-哔哩哔哩】 https://b23.tv/9lDUMWf


另,如果你的机器,使用48个核心跑,可能效果更佳。
具体,查询本人之前的部分留言信息。

High-Performance Computing for You
为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
https://labitc.top
http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-20 21:00:19 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2022-4-20 18:05
谁告诉你的,核心越多跑得越快呢?

vasp并行线性很好的……

谢谢老师,应该是内存的问题,这台机器的内存条只插了一半

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