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楼主 Author: 978142355
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[Multiwfn使用咨询] Linux系统下利用Multiwfn进行盆分析时输出盆作为cube文件时出错

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-4-12 16:06:08 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 978142355 于 2016-4-12 16:34 编辑
sobereva 发表于 2016-4-12 12:23
你把你的Multiwfn输入文件,完整的操作步骤(最好把屏幕上的输出也都拷到文本文件里附上)都打包发上来我 ...

辛苦老师了,过程图片里是我在linux和windows下分别截图做的,同一文件,linux下有问题,而windows正常。输入文件由于有些大,放在百度云里了。
链接:http://pan.baidu.com/s/1sl7TzQX 密码:3hn6

过程图片.rar

2.61 MB, 下载次数 Times of downloads: 8

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发表于 Post on 2016-4-12 23:50:14 | 只看该作者 Only view this author
978142355 发表于 2016-4-12 16:06
辛苦老师了,过程图片里是我在linux和windows下分别截图做的,同一文件,linux下有问题,而windows正常。 ...

我也没办法,用你的输入文件、你的操作步骤,我这里一点问题没有。
你也可以尝试把basinana.f90里的173行开始的段落以不同方式改写,反复尝试。那个部分是选项-5输出cube文件的。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-4-13 20:25:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-4-12 23:50
我也没办法,用你的输入文件、你的操作步骤,我这里一点问题没有。
你也可以尝试把basinana.f90里的173 ...

恩,老师费心了,不知道是不是在虚拟机中跑不动造成的,我把电脑安上redhat最后再试一试,不行只能在windows下进行了。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-4-14 21:13:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-4-12 23:50
我也没办法,用你的输入文件、你的操作步骤,我这里一点问题没有。
你也可以尝试把basinana.f90里的173 ...

报告老师,我在电脑上安装上了redhat系统,对于小的*.cub,运行成功了,但是对于大的文件(约100MB)则运行就会出现那个core dumped,这说明是文件大小的问题了,但是大的文件出现这个问题是怎么回事,是不是我内存或是硬盘大小设置的不对?(PS:配置的时候都是按照老师的手册中默认进行的,我的home分区是250G)。
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发表于 Post on 2016-4-14 21:59:59 | 只看该作者 Only view this author
978142355 发表于 2016-4-14 21:13
报告老师,我在电脑上安装上了redhat系统,对于小的*.cub,运行成功了,但是对于大的文件(约100MB)则运 ...

和硬盘无关。主要是内存,如果内存实际剩余空间足够大,kernel.shmmax设得也足够大,那就也没什么其它导致这个问题的原因了。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-4-14 22:21:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-4-14 21:59
和硬盘无关。主要是内存,如果内存实际剩余空间足够大,kernel.shmmax设得也足够大,那就也没什么其它导 ...

roger,好,我知道了,我明天按照老师的思路再弄一下,希望能好使,谢谢老师。
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