关于计算NTO的结果问题

zzl7337 · 发表于 Post on 2016-3-24 13:48:24

老师：
你好。我想请问一下计算NTO之后。（我算的是三线态T1的NTO）。我转换成Fch之后，用gaussview打开，看到的所谓Hole 和particle轨道系数为595和596号。可是按照老师那篇文章《跃迁密度分析方法-自然跃迁轨道(NTO)简介》中提到的，进入输出文件去查
Alpha  occ.eigenvalues -- 0.00000 0.00000  0.00000 0.00000 0.00000
Alpha  occ. eigenvalues-- 0.00000 0.00000  0.00001 0.00003 0.00005
Alpha  occ. eigenvalues-- 0.00008 0.00018  0.00077 0.00611 0.99276
Alpha virt. eigenvalues-- 0.99276 0.00611  0.00077 0.00018 0.00008
Alpha virt. eigenvalues-- 0.00005 0.00003  0.00001 0.00000 0.00000
Alpha virt. eigenvalues-- 0.00000 0.00000  0.00000 0.00000 0.00000
结果确实192和193号轨道。
请问这是什么原因？是按照哪个画轨道？

sobereva · 发表于 Post on 2016-3-24 23:12:23

gview里根本没法进行判断
看哪个轨道按照博文里说的确定

让你变成回忆 · 发表于 Post on 2017-11-2 20:40:06

sobereva 发表于 2016-3-24 23:12
gview里根本没法进行判断
看哪个轨道按照博文里说的确定

借楼请教sob老师一个问题：
现在我想在Linux下用Gaussian自带的cubegen程序产生cube文件，然后用于vmd作图。比如我看HOMO轨道的时候可以在fchk文件中找alpha electron这样的关键词，如果是NTO，我应该用什么关键词去找NTO对儿的贡献呢？谢谢sob老师~

sobereva · 发表于 Post on 2017-11-3 15:24:07

让你变成回忆发表于 2017-11-2 20:40
借楼请教sob老师一个问题：
现在我想在Linux下用Gaussian自带的cubegen程序产生cube文件，然后用于vmd作 ...

用Multiwfn做NTO分析，
使用Multiwfn做自然跃迁轨道(NTO)分析
http://sobereva.com/377

然后如果想用VMD作图，按照此文把那些轨道导出成cube文件即可
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269

Multiwfn做NTO比高斯方便太多。

让你变成回忆 · 发表于 Post on 2017-11-3 15:26:28

sobereva 发表于 2017-11-3 15:24
用Multiwfn做NTO分析，
使用Multiwfn做自然跃迁轨道(NTO)分析
http://sobereva.com/377

好的~ 谢谢sob老师

lijiaqi · 发表于 Post on 2018-5-19 15:50:56

sobereva 发表于 2017-11-3 15:24
用Multiwfn做NTO分析，
使用Multiwfn做自然跃迁轨道(NTO)分析
http://sobereva.com/377

老师，你好。我一直解决不了这个问题，麻烦你看下。6 //NTO分析
examples\NTO\uracil.out
这里out文件是怎么操作的。谢谢老师
2. 对于激发态提交的fchk 文件，请问激发态是直接做的td,还是opt td,谢谢老师。

让你变成回忆 · 发表于 Post on 2018-5-19 16:29:02

本帖最后由让你变成回忆于 2018-5-19 17:02 编辑

lijiaqi 发表于 2018-5-19 15:50
老师，你好。我一直解决不了这个问题，麻烦你看下。6 //NTO分析
...

（1）就是你计算TD对应的out文件，Multiwfn会通过out文件去读组态系数。让你输入out文件的路径的时候直接把out文件拖进窗口就行了呗~
（2）看你是垂直激发还是发射了。如果是激发，就是td的fchk文件；发射我没做过，不清楚~不过应该是可以基于优化的激发态结构，做一次TD，然后就像激发一样处理了

lijiaqi · 发表于 Post on 2018-5-19 18:57:12

让你变成回忆发表于 2018-5-19 16:29
（1）就是你计算TD对应的out文件，Multiwfn会通过out文件去读组态系数。让你输入out文件的路径的时候直接 ...

好的，谢谢，由于我的高斯输出的是log文件，一直不可以，这个怎么办，谢谢

sobereva · 发表于 Post on 2018-5-19 22:22:10

lijiaqi 发表于 2018-5-19 18:57
好的，谢谢，由于我的高斯输出的是log文件，一直不可以，这个怎么办，谢谢

out和log一码事，后缀不同而已。
你一看自带的例子uracil.out里的关键词立马就明白该怎么写了

lijiaqi · 发表于 Post on 2018-5-20 16:12:07

sobereva 发表于 2018-5-19 22:22
out和log一码事，后缀不同而已。
你一看自带的例子uracil.out里的关键词立马就明白该怎么写了

好的，谢谢老师

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