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[Lammps] 用lammps算热传导系数如何算virial部分的贡献?

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rt. 本人想把kappa matrix分解成KE,PE 和virial部分,已搞定了标量的KE和PE部分,但由于stress 是6个element的vector,不太清楚如何算virial的heat flux vector S*v.

compute myStress all stress/atom virial
variable mySvx atom c_myStress*vx
variable mySvy atom c_myStress*vy
variable mySvz atom c_myStress*vz
compute mySvx all reduce sum v_mySvx
compute mySvy all reduce sum v_mySvy
compute mySvz all reduce sum v_mySvz
fix JJS all ave/correlate $s $p $d c_mySvx c_mySvy c_mySvz type auto file J0Jt.dat ave running
这样应该有问题吧?那么stress的维度该如何修改呢? 不胜感激!

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