能量最小化进行不下去

吧唧爱吃糖 · 发表于 Post on 2022-6-24 15:33:24

牧生发表于 2022-6-24 14:59
基本合理了，自己再琢磨一下就行了。。如果还不行，尝试把盒子再略加大点。真空层没关系，NPT的时候会自 ...

好的，感谢师兄耐心指点。祝师兄科研顺利，健康平安

吧唧爱吃糖 · 发表于 Post on 2022-6-24 16:21:45

牧生发表于 2022-6-24 14:59
基本合理了，自己再琢磨一下就行了。。如果还不行，尝试把盒子再略加大点。真空层没关系，NPT的时候会自 ...

但是师兄用这个模型跑最小化还是报一样的错误。是因为我这个盒子太小里面分子太多导致的吗？还是说我的mdp文件应该把最大力收敛条件调大那？

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[GROMACS] 能量最小化进行不下去