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[综合交流] 请问MMFF94力场获得的聚合物电荷能适用溶剂环境下情况吗?

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各位老师好,我在模拟一个聚合物在超临界CO2溶剂环境下的体系,其中聚合物的拓扑结构与原子电荷由sobtop并调用MMFF94力场快速生成,CO2用的EPM2模型

在模拟过程中发现溶质的轨迹总是朝盒子边缘跑,分析其Rg也没有到达文献预期的情况,

请问是因为MMFF94力场无法描述该环境下的溶质和溶剂间的相互作用吗?

如果采用RESP原子电荷拟合的话,需要自定义溶剂模型的相对介电常数,但我搜到CO2在不同条件下相对介电常数会有差异,请问能取一个均值吗?

谢谢各位老师

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发表于 Post on 2022-7-16 20:26:54 | 只看该作者 Only view this author
溶质朝盒子边缘跑什么也不说明,本来用PBC的话在盒子哪里都一样,有意义的只是不同组分的相对位置
MMFF94电荷只是很凑合的原子电荷,实际如果发现不好就应该换掉。
我不知道你要在什么条件下做模拟。对不同条件分别用Multiwfn算RESP电荷最好,但图省事的话,而且你要研究的不同条件下介电常数差异不十分大,因此原子电荷差异也不显著的话,取平均值倒也可以。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-16 20:38:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-7-16 20:26
溶质朝盒子边缘跑什么也不说明,本来用PBC的话在盒子哪里都一样,有意义的只是不同组分的相对位置
MMFF94 ...

谢谢老师回答,我再去试试

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