第11届北京科音分子动力学与GROMACS培训班获得圆满成功！

TyDRfan · 发表于 Post on 2022-8-18 22:43:45

在经历了本次培训后，可以用醍醐灌顶来形容！Sob老师专业且系统地讲解了分子动力学模拟计算的理论知识，并以GROMACS（包含但不限于）程序为主体，讲述了分子动力学模拟思路、模拟方法，并结合VMD等对计算化学科研制图及数据后续的处理分析进行了详细教学，对于我一个计算化学新手来说十分友好，收获巨大！本次培训内容极为丰富，在课后仍需很长一段时间进行复习、消化、实操。对之前自己稀里糊涂的模拟经历有了深刻反思并加深了理解，同时使之后的模拟过程有了清晰的思路，再次真心感谢Sob老师！！！！！

test521 · 发表于 Post on 2022-9-14 14:45:38

佩服卢老师的精力

mol · 发表于 Post on 2022-9-25 09:52:50

期待高级班赶快上
另外卢老师现在培训班用的gmx是哪个版本呀

sobereva · 发表于 Post on 2022-9-26 05:22:55

mol 发表于 2022-9-25 09:52
期待高级班赶快上
另外卢老师现在培训班用的gmx是哪个版本呀

2018.8。后来的版本不断砍功能，对编译器版本要求不断提升，除了追求GPU加速性外没有太大更到更新版本的意义。
最新版本相对于2018.8所做的所有相对重要的改进，比如后来引入的multiple-time step、C-rescale压浴等，课上都会说。所以不需要担心漏掉什么重要信息

想喝可乐 · 发表于 Post on 2022-10-27 18:27:07

sob老师，请问一下我想学习gromacs需要去参加11月12号的初级量子化学培训班吗，如果需要的话我可以来北京，我做的是液态二氧化碳增稠方向的，想通过分子角度模拟出具体的过程，谢谢老师

sobereva · 发表于 Post on 2022-10-28 01:51:18

想喝可乐发表于 2022-10-27 18:27
sob老师，请问一下我想学习gromacs需要去参加11月12号的初级量子化学培训班吗，如果需要的话我可以来北京， ...

不是必须参加，但分子动力学模拟和量子化学有有一些交叉点，比如自己用量子化学程序做势能面扫描然后拟合力场参数、基于量子化学程序计算原子电荷等等，有量子化学知识绝对有好处，也能开阔眼界。而且很多问题如果把分子动力学和量子化学结合起来，分析的时候视角更为全面，能讨论更为深入，也更容易出好文章。比如分子间相互作用，可以通过分子动力学从动态角度考察表观现象，同时可以再结合量子化学和波函数分析手段对相互作用的本质做更细致深入的探讨。

想喝可乐 · 发表于 Post on 2022-11-1 21:22:39

sob老师，今天重庆大学附近新增一例阳性患者，目前学校已经开始限制出行，三天三检了，之前我已经报名参加培训了，但是钱还没交，按照防疫要求我可能来不了了，您之前说过要是学gmx的话量子化学班不是必须参加的，抱歉给您添麻烦了，邮箱也会尽快回的，实在抱歉

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[动力学与GMX班] 第11届北京科音分子动力学与GROMACS培训班获得圆满成功！

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