VASP计算AIMD,结构变化程度大

种花家的蓝兔 · 发表于 Post on 2022-8-23 16:40:21

本帖最后由种花家的蓝兔于 2022-8-23 16:41 编辑

请问各位前辈，用VASP计算分子动力学，目的想看结构的稳定性。一个单层二维结构，参考文献上写明了独立的这个单层二维结构是稳定的，但是我计算将近1000步之后（1ps），结构严重变形，如下图。【用的和文献一样的系综、恒温器、时间步长】按理说有文献做出来它是稳定的，应该是可以证明稳定性的吧。所以我想请问各位前辈老师，做AIMD时，对分子结构影响程度大的参数有哪些

Eudaimonia · 发表于 Post on 2022-8-23 18:51:15

AIMD之前弛豫过么，弛豫一下会好点

种花家的蓝兔 · 发表于 Post on 2022-8-23 19:04:04

Eudaimonia 发表于 2022-8-23 18:51
AIMD之前弛豫过么，弛豫一下会好点

弛豫过了

waitingseven · 发表于 Post on 2022-8-23 20:09:35

真空层厚度也跟文献一致吗

种花家的蓝兔 · 发表于 Post on 2022-8-23 20:26:15

waitingseven 发表于 2022-8-23 20:09
真空层厚度也跟文献一致吗

是的，at least 20埃

Eudaimonia · 发表于 Post on 2022-8-23 21:47:54

按我不多的AIMD经验来看，体系大一点更稳定，我单胞跑5ps很容易结构跑乱，但是2x2超胞就不会

waitingseven · 发表于 Post on 2022-8-23 22:03:24

种花家的蓝兔发表于 2022-8-23 20:26
是的，at least 20埃

是不是用的K点不一样，我看晶胞很小，如果直接用gamma点肯定不行

种花家的蓝兔 · 发表于 Post on 2022-8-23 22:35:20

waitingseven 发表于 2022-8-23 22:03
是不是用的K点不一样，我看晶胞很小，如果直接用gamma点肯定不行

不是gamma点,MP那个

种花家的蓝兔 · 发表于 Post on 2022-8-23 23:10:50

Eudaimonia 发表于 2022-8-23 21:47
按我不多的AIMD经验来看，体系大一点更稳定，我单胞跑5ps很容易结构跑乱，但是2x2超胞就不会

我这是3×3的

。请问您的结构是单层的吗

Eudaimonia · 发表于 Post on 2022-8-24 08:34:30

种花家的蓝兔发表于 2022-8-23 23:10
我这是3×3的。请问您的结构是单层的吗

单层石墨，单原子的结构，按原始的石墨晶胞来算我那个可能有14x14了

种花家的蓝兔 · 发表于 Post on 2022-8-24 08:43:50

Eudaimonia 发表于 2022-8-24 08:34
单层石墨，单原子的结构，按原始的石墨晶胞来算我那个可能有14x14了

是用的NVT系综吗，如果是的话，方便说一下SMASS设置的值是多少吗

Eudaimonia · 发表于 Post on 2022-8-24 09:01:18

种花家的蓝兔发表于 2022-8-24 08:43
是用的NVT系综吗，如果是的话，方便说一下SMASS设置的值是多少吗

不太确定，我用的cp2k计算，分子动力学相关的设置只设置了Nose-Hoover热浴，我也不确定算哪种

种花家的蓝兔 · 发表于 Post on 2022-8-24 09:06:47

Eudaimonia 发表于 2022-8-24 09:01
不太确定，我用的cp2k计算，分子动力学相关的设置只设置了Nose-Hoover热浴，我也不确定算哪种

好的，谢谢您

CHLllooll · 发表于 Post on 2023-12-11 22:08:35

种花家的蓝兔发表于 2022-8-24 09:06
好的，谢谢您

前辈你好，请问问题解决了吗

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