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楼主 Author: wuy069
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[CASTEP/Dmol3/MS] 【已解决】求助:MaterialsStudio 2020以下版本在RHEL/CentOS 8系统的运行

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发表于 Post on 2022-9-6 10:53:22 | 只看该作者 Only view this author
ms2019-running-Rocky8-case2.mp4 (282.54 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-6 11:27:04 | 只看该作者 Only view this author

我刚才建了个虚拟机,rocky linux 8.6,使用singularity运行MS的确没问题,但是实体机就是不好使,特别奇怪[笑哭]。
再次感谢王老师!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-6 14:49:26 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2022-9-6 10:12
你用了这么快的时间, 就看了你认为重要的东西.

可是我认为你根本就没有看你应该看的东西.

这些对我来说并不难,我也不是一个新手,只是想讨论找到问题的症结。简单极速高效构建高性能计算集群https://www.bilibili.com/video/BV1434y1j75R?spm_id_from=444.42.list.card_archive.click&vd_source=4147cbee137da2d405cd809d90528c4b
这个是我做的,希望有机会和王老师多交流讨论[抱拳]!

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发表于 Post on 2022-9-6 19:24:25 | 只看该作者 Only view this author
wuy069 发表于 2022-9-6 14:49
这些对我来说并不难,我也不是一个新手,只是想讨论找到问题的症结。简单极速高效构建高性能计算集群http ...

可能指出哪里出错了,很不礼貌。

我的意思是说,
容器技术,尤其是singularity 这种,
也有可能继承你在主机的某些设定。

如果你能保持你的主机运行环境干净,
那么,镜像中的东西,
只核内核打交道了,
会无视你的设定的,除非你在主机上做了某些非常牛逼的全局性的设定。

系统配置丰富多样,
我并不晓得你做过什么设定。

从你的描述来看,他人做的镜像没问题,
你做的没法用,
这不难推定,你的系统部分设定可能有问题,
或者你在搞SIF的时候,有部分操作配置不当。

因为,单机都跑不起来,其实和集群没有关系的。

你说的bug,我见别人描述一次,
那边重做了一下系统,又全都正常了。具体故障原因不明,反正是解决了。

喊我abin 就好。

能力有限,有愧老师这个称谓。
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发表于 Post on 2022-10-9 21:31:47 | 只看该作者 Only view this author
MS安装系统用红帽最好,其它版本我都用过,不是编译出问题就是计算结果大大的出乎意料
越努力越幸运!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-10 14:11:10 | 只看该作者 Only view this author
xylz6188 发表于 2022-10-9 21:31
MS安装系统用红帽最好,其它版本我都用过,不是编译出问题就是计算结果大大的出乎意料

已解决,谢谢!这个主要是MS自带intel mpi 2018/2019在高版本系统的问题.
用singularity容器可以解决,但是限于RHEL/CentOS/Rocky Linux 8.5及以下版本,用Rocky Linux 8.6在实体机总有问题,我把计算节点系统版本都降为8.5都好了。

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发表于 Post on 2022-10-15 16:14:50 | 只看该作者 Only view this author
您好,最近尝试集群下MS2020的安装,用slurm管理,请问是否可以提供一个教程,谢谢~

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-19 22:41:11 | 只看该作者 Only view this author
alexpanji 发表于 2022-10-15 16:14
您好,最近尝试集群下MS2020的安装,用slurm管理,请问是否可以提供一个教程,谢谢~

正常管理就行,也不需要啥教程,我们使用standlone方式运行MaterialsStudio,所以跟Gaussian这些软件管理一样

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