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[VASP] VASP每个计算任务用多少核比较合适呢

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Level 4 (黑子)

      小弟,用vasp计算,感觉计算速度非常慢。现在每个任务用30核(服务器总共32核),每次跑一个任务,感觉很慢。不知道每个任务少用一些核,同时多跑几个任务是不是效率会更高呢

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Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2016-5-6 10:53:44 | 只看该作者 Only view this author
正好,那天南京大学计算中心的人讲过这个问题。我给出如下回答(转自南大计算中心负责人):
(1)如果前端总线和内存以及硬盘读写数度够快,开启超线程,满CPU运行,注意千万不要跨电脑(节点运行,在下面一条);
(2)如果前端总线以及内存和硬盘读写数度相对不够,首先关闭超线程,其次预留CPU(比如你有20核,现在用18-19核)。
(3)如果是跨节点运行,尽量少的跨节点进行计算,比如你有三台10核心的电脑,你的CPU设置一般是8,9,10或者就是18,19,20,或者就是28,29,30.这个时候你如果用11核肯定比9核要慢。即使你用的是万兆光钎通讯,一样(千兆并行效率一般在50,万兆铜线在70%,光钎在80%左右,据说infiniband能有90%)。
(4)总之一句话,VASP能一台电脑搞定就一台电脑。

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