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[分子对接] 求助:使用UCSF DOCK6.9进行分子对接出现对接盒子大小问题

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使用DOCK对小分子进行Hawkins GB/SA 评分,hawkins_gbsa_dock.out出现以下报错:
ERROR:  Could not complete growth.
         Confirm that the grid box is large enough to contain the ligand,
         and try increasing max_orientations.

对hawkins_gbsa_dock.in文件中max_orientations进行修改,增加数值,仍然报错
求大神指教

EG]N3MW[%S}X4N7%CWL}WA4.png (71.41 KB, 下载次数 Times of downloads: 25)

报错图示

报错图示

hawkins_gbsa_dock.in

4.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

lig.min_scored.mol2

7.12 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

lig_charged.mol2

5.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

rec_box.pdb

785 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0

rec_charged.mol2

333.87 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

rec_noH.pdb

195.12 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

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发表于 Post on 2024-12-6 16:39:40 | 只看该作者 Only view this author
请问您申请dock6的时候是使用的教育邮箱申请吗,我一直卡在提交页面

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发表于 Post on 2025-10-3 15:18:48 | 只看该作者 Only view this author
zzz111zzz 发表于 2024-12-6 16:39
请问您申请dock6的时候是使用的教育邮箱申请吗,我一直卡在提交页面

请问申请到了吗?我提交好久了,一直是pending

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