作电子密度差图得出结果有异

楠楠

各位老师好 想请教一下  学生做电子密度差图，是含有两个溴的体系（未与主链相连），我用整体减去两个溴再减去剩余部分，得到如下图。溴的周围是蓝色 我能理解 电子密度降低了 因为部分电子转移到了主链 可是主链不应该是绿色吗？为啥主链也有蓝色 还很多呢？

wudiazhu

你的电荷没设对，整体应该带-2电荷

楠楠

wudiazhu 发表于 2022-11-16 09:11
你的电荷没设对，整体应该带-2电荷

我将整体的改为 （-2,3）算了一下 还是不对 也是主链同时有蓝和绿色分布

冰释之川

楠楠 发表于 2022-11-16 09:42
我将整体的改为 （-2,3）算了一下 还是不对 也是主链同时有蓝和绿色分布

主链有电子密度增加与减少的区域交替出现不是很正常的么，就像一颗石头引起的涟漪，总有起伏传递开来的。。不放心的话，你对电子密度差函数在主链原子空间下进行积分，得到的值应该是正值

楠楠

冰释之川 发表于 2022-11-16 10:08
主链有电子密度增加与减少的区域交替出现不是很正常的么，就像一颗石头引起的涟漪，总有起伏传递开来的。 ...

好的老师 主要是我怕我这样证明溴电子转移到主链会被审稿人质疑。
老师能请教一下  这个在主链原子空间下进行积分 是可以通过multiwfn直接输出的吗？还是需要自己进行积分计算

冰释之川

楠楠 发表于 2022-11-16 10:11
好的老师 主要是我怕我这样证明溴电子转移到主链会被审稿人质疑。
老师能请教一下  这个在主链原子空间 ...

Multiwfn手册里能完成，具体看模糊原子空间分析。
最终效果可以参考这种图(https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcc.9b08050)：

楠楠

冰释之川 发表于 2022-11-16 10:13
Multiwfn手册里能完成，具体看模糊原子空间分析。
最终效果可以参考这种图(https://pubs.acs.org/doi/10 ...

老师想请教一下 是指这样做吗？

冰释之川

楠楠 发表于 2022-11-16 15:40
老师想请教一下 是指这样做吗？

是的，但是最后一步要选自定义函数，具体的看Multiwfn手册

楠楠

冰释之川 发表于 2022-11-16 10:08
主链有电子密度增加与减少的区域交替出现不是很正常的么，就像一颗石头引起的涟漪，总有起伏传递开来的。 ...

老师好 我按照您的指导分别对主链和两个溴进行了积分计算
得出的主链数值为1599  两个溴是281
请问老师二者输出的值分别约为16%和2.8%  如何说明电子转移到了主链上呢？或者说主链的电子密度增加了呢？