如何确定体系内基团上的两个质子转移先后顺序？

杨小狗 · 发表于 Post on 2016-6-6 21:27:00

这两个质子从不同的羟基上向一个吸电子羰基基团转移。我认为有几种情况，一种是两个质子转移快慢有别，谁快谁慢怎么看出来呢？通过转移速度吗？另一种是两个质子同时转移，不分先后顺序。求教，求解释。

杨小狗 · 发表于 Post on 2016-6-6 21:48:02

能否通过计算电子的定域和非定域指数的变化，看那个氢原子的去质子化能力强从而证明哪个质子先转移？
或者通过氢键的强弱导致弛豫的剧烈程度并通过势能曲线势垒的高低来判断哪个先转移？
或者通过质子运动的速度？如何求解速度v 呢？
@Sobereva 老师

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2016-6-6 22:07:23

直接算A先、B先、协同三条路径，比较速率快慢（决速的活化能高低）就可以了。协同过程中有时也有先后。

sobereva · 发表于 Post on 2016-6-7 05:22:39

3L是常规做法，有兴趣也可以跑从头算动力学，更为直观

杨小狗 · 发表于 Post on 2016-6-7 14:07:18

sobereva 发表于 2016-6-7 05:22
3L是常规做法，有兴趣也可以跑从头算动力学，更为直观

我想了解一下从头算动力学是跑半经典轨线吗？这个我没接触过所以恳请老师详细的告诉一二，或者推荐我如何进行学习这个方法。谢谢！

杨小狗 · 发表于 Post on 2016-6-7 14:08:30

liyuanhe211 发表于 2016-6-6 22:07
直接算A先、B先、协同三条路径，比较速率快慢（决速的活化能高低）就可以了。协同过程中有时也有先后。

感谢前辈回答，但是您说的我不懂啊，如何命令计算各种路径呢？决速的活化能是？

sobereva · 发表于 Post on 2016-6-7 14:50:20

杨小狗发表于 2016-6-7 14:07
我想了解一下从头算动力学是跑半经典轨线吗？这个我没接触过所以恳请老师详细的告诉一二，或者推荐我如何 ...

用高斯的ADMP或BOMD来跑

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2016-6-7 15:20:49

杨小狗发表于 2016-6-7 14:08
感谢前辈回答，但是您说的我不懂啊，如何命令计算各种路径呢？决速的活化能是？

命令都是找过渡态的命令，提供不同的初猜。

杨小狗 · 发表于 Post on 2016-6-7 16:50:12

liyuanhe211 发表于 2016-6-7 15:20
命令都是找过渡态的命令，提供不同的初猜。

谢谢前辈

杨小狗 · 发表于 Post on 2016-6-7 16:50:23

sobereva 发表于 2016-6-7 14:50
用高斯的ADMP或BOMD来跑

谢谢老师！！

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[综合交流] 如何确定体系内基团上的两个质子转移先后顺序？