请问用packmol+moltemplate建模，lt文件里的原子坐标xyz是否可以任意填写

熊熊熊 · 发表于 Post on 2023-2-9 22:47:56

本帖最后由熊熊熊于 2023-2-9 23:12 编辑

如题，我打算用packmol+moltemplate完成建模。在已经使用packmol获得包含所有原子坐标的pdb文件后，书写moltemplate的lt文件write("Data Atoms")部分时原子坐标xyz是否可以随意填写，对最后建模结果是否有影响呢？
请各位大佬赐教，谢谢！

熊熊熊 · 发表于 Post on 2023-2-9 22:50:33

题目打错了

，输入法没调过来，应该是请问用packmol+moltemplate建模，lt文件里的原子坐标xyz是否可以任意填写

gromacs666 · 发表于 Post on 2023-2-17 08:43:06

应该不行，最好严格一致。
我也是用的这个方法，如果你想修改，就在pdb那里使用ms建模时候修改

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