PSI4研究蛋白-配体相互作用求助

MrMr浩 · 发表于 Post on 2023-2-15 14:04:02

各位老师，我在做一个蛋白共价抑制剂，通过过渡态搜索发现，共价头的活性对能垒影响微乎其微，于是想探究弱相互作用对化合物活性的影响。
现有几个化合物在取代基上存在差异，事先已经通过aNCI确定了哪些区域存在弱相互作用，现在想定量比较。是否可以将配体划分成几部分，单独对某一部分及其发生弱相互作用的残基用PSI4计算，探究该部分弱相互作用定量的差异？

DwyaneWan · 发表于 Post on 2023-2-16 02:57:48

用SAPT-D3去做300个原子基本上也是可以的。
doi.org/10.1063/5.0049745

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[PSI4] PSI4研究蛋白-配体相互作用求助

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