计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 13818|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[其它程序] CALYPSO结合VASP进行团簇结构搜索问题

[复制链接 Copy URL]

41

帖子

0

威望

201

eV
积分
242

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
求助各位大神:1.用calypso结合vasp进行团簇结构搜索,发现搜索出来的结构有差不多一半能量是正值,而且原子都散开了,是怎么回事?INCAR设置的问题吗?
2.找到搜索出来最稳定的一个结构,显示能量是-4.1eV(体系用6个原子,所以总的能量是-24.6eV),之后用vasp计算对calypso的结构进行验证,发现能量是-20.0eV,两者差4eV,这说明calypso的结果不准确吗?还是别的问题,应该如何解决?之前没有接触过vasp,只是想用vasp结合calypso来搜索一下团簇结构,看自己考虑的团簇结构全了没。谢谢各位老师!
搜索结构时的INCAR:
SYSTEM=Pt5Cu1
#NELMIN=20
EDIFF=1E-3
EDIFFG=-0.1
NSW=200
IBRION=2
#ALGO=Fast
LREAL=.FALSE.
POTIM=0.5
ISIF=2
ENCUT=250
ISTART=0
ICHARG=2
ISPIN=2
ISMEAR=0
SIGMA=0.001
PREC=Low
进行优化验证时的INCAR:
SYSTEM=Pt5Cu1
#NELMIN=20
EDIFF=1E-5
EDIFFG=-0.01
NSW=200
IBRION=2
#ALGO=Fast
LREAL=.FALSE.
POTIM=0.5
ISIF=2
ENCUT=600
ISTART=0
ICHARG=2
GGA=PE
ISMEAR=0
ISPIN=2
SIGMA=0.001
PREC=Accurate

1

帖子

1

威望

18

eV
积分
39

Level 2 能力者

2#
发表于 Post on 2016-6-17 14:45:04 | 只看该作者 Only view this author
1. 有可能是真空层不够大,不同晶胞内的原子产生了相互作用,导致优化过程中变成晶体,所以结构散了。适当增加真空层厚度试试。
2.你在预测时候时用的INCAR和后期分析时用的INCAR精度差别很大,导致能量会有很大差别。预测时采用的INCAR精度太低了,EDIFF至少该设置成1E-4。
在做预测之前应该对体系的ENCUT , 真空层做下测试,防止参数精度设置过低,得到不合理的结果。

评分 Rate

参与人数
Participants 2
威望 +1 eV +8 收起 理由
Reason
jiewei + 1 + 7
sobereva + 1

查看全部评分 View all ratings

41

帖子

0

威望

201

eV
积分
242

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-17 15:23:47 | 只看该作者 Only view this author
暴力窝头 发表于 2016-6-17 14:45
1. 有可能是真空层不够大,不同晶胞内的原子产生了相互作用,导致优化过程中变成晶体,所以结构散了。适当 ...

哦,好的。谢谢您!我自己再测试一下看看结果。

207

帖子

0

威望

2300

eV
积分
2507

Level 5 (御坂)

4#
发表于 Post on 2016-6-17 17:43:44 | 只看该作者 Only view this author
暴力窝头 发表于 2016-6-17 14:45
1. 有可能是真空层不够大,不同晶胞内的原子产生了相互作用,导致优化过程中变成晶体,所以结构散了。适当 ...

感谢彦超兄回复

72

帖子

0

威望

478

eV
积分
551

Level 4 (黑子)

5#
发表于 Post on 2016-7-7 19:54:49 | 只看该作者 Only view this author
calypso研发团队有专门的答疑群,群号是96259578,calypso团队的牛人都在群里边回答问题。团簇相关的问题你可以去群里问吕健老师,他是专门负责团簇模块的。

207

帖子

0

威望

2300

eV
积分
2507

Level 5 (御坂)

6#
发表于 Post on 2016-7-15 11:13:00 | 只看该作者 Only view this author
物理小笨 发表于 2016-7-7 19:54
calypso研发团队有专门的答疑群,群号是96259578,calypso团队的牛人都在群里边回答问题。团簇相关的问题你 ...

吉大王博士和我一起商量专门开辟的这个模块,主要是为了解决有些大问题需要反复讨论的问题。已经留下一些可以随时网络查询的讨论。而且王博士会常过来解答一些相关问题

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 09:41 , Processed in 0.243168 second(s), 30 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list