求助：gmx_mpi select 指令，-select后面怎么写2个氨基酸5埃范围的选区范围？

灵芝5

各位老师好！

我想用gmx_mpi select指令计算E6和R8氨基酸5埃范围内的钠和氯离子的个数或滞留时间；之前计算了单个6号氨基酸周围5埃范围的CL离子，用的指令如下：
gmx_mpi select -s ../../full.tpr -f ../../full_fit.xtc -of 300-2-E6-CL-of.xvg -on 300-2-E6-CL.ndx -oi 300-2-E6-CL.dat -os 300-2-E6-CL.xvg -b 0 -e 2000000 -select 'name CL and within 0.5 of residue 6'

现在想计算2个氨基酸E6和R8周围5埃范围的NA和CL。请问-selecth后面的 'name CL and within 0.5 of residue 6'选择范围应该怎么改写？

sobereva

我更习惯用VMD
比如运行[atomselect top "ion within 5 of resid 6 8"] num就返回给你残基6、8附近5埃距离内的离子中原子的数目

选择语句参考
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

灵芝5

谢谢卢老师答复！