计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 719|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 关于在溶液中如何考虑具体的ph值的问题

[复制链接 Copy URL]

216

帖子

0

威望

1099

eV
积分
1315

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
请问各位老师,关于如何在溶液中考虑ph值的变化有几个问题,希望老师指导一下1. 请问如何在构建模型,按照水和H+或者OH-的比例去混合,单独的设置每个H或者OH的价态,然后设置整个溶液是电中性吗?

2. 之前卢老师在群里说通过质子化态体现,应该如何恰当设置质子化态呢,比如水溶液,溶质是聚丙烯酸。
3. 算溶剂效应下的结合能和跑分子动力学,对于建立酸性或者碱性的盒子,是不是都可以在溶液中加入H+或者OH-这种方法来实现呢?

1万

帖子

0

威望

7402

eV
积分
18169

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2023-4-27 19:59:13 | 只看该作者 Only view this author
1. 不是设置价态的问题。有两种方法:(1)往溶液里加适量的H3O+(注意不是H+)或OH-,并加适量的、适当种类的抗衡离子(默认可以用Na+或Cl-,但是如果实验用的buffer不是含Na+或Cl-的buffer,需要按实验实际buffer成分选择抗衡离子),缺点是你只能控制初始pH,控制不了体系达到酸碱平衡以后的pH;(2)直接改变溶质的质子化态,并加适当的抗衡离子。其中如果溶液里本来就有抗衡离子了,那么“加抗衡离子使溶液变成电中性”也可以改成“减少抗衡离子使溶液变成电中性”,具体是增加还是减少离子取决于你需要多大的离子强度。注意不能只改变电荷使得体系是电中性,而不改变抗衡离子的数目,否则离子会被还原(或氧化)成自由基,就不是你想要研究的体系了。
2. 参见https://mattermodeling.stackexch ... molecules/9605#9605
3. 答案同1
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

216

帖子

0

威望

1099

eV
积分
1315

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-27 20:06:11 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-4-27 19:59
1. 不是设置价态的问题。有两种方法:(1)往溶液里加适量的H3O+(注意不是H+)或OH-,并加适量的、适当种 ...

好的,谢谢老师,明白了

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 17:42 , Processed in 0.322078 second(s), 26 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list