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[配置讨论] 软件用lammps,想买两台服务器,求建议

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组里确定了使用MD的研究方法,我和我师兄主做,软件用的lammps,研究模拟体系几万个原子起步。现在准备购置两台服务器,整体预算6W内。一台想用GPU加速,配置打算上7950X+4090。另一台想上个双路CPU,配置打算上8375C*2。想法就是两台比较着使用一下,想问问各位有过使用经验的大佬们这想法可行吗?因为我看网上说用GPU加速算的效率比用CPU高很多,怕到时候买了双路服务器浪费掉。

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发表于 Post on 2023-6-7 22:37:10 | 只看该作者 Only view this author
逐句、仔细阅读 http://bbs.keinsci.com/thread-35988-1-1.html

刚刚特意为你做了更新。
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发表于 Post on 2023-6-7 23:25:42 | 只看该作者 Only view this author
需要考虑你要用哪种力场,有的力场不支持kokkos加速。如果支持的话,可以上两台7950X+2*4090
另外还有一种很邪道的搭配方式,就是双路服务器插个六到八张P100,不考虑P100报销困难和踩雷的问题的话,性价比极高。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-7 23:37:44 | 只看该作者 Only view this author
Entropy.S.I 发表于 2023-6-7 22:37
逐句、仔细阅读 http://bbs.keinsci.com/thread-35988-1-1.html

刚刚特意为你做了更新。

好的!谢谢老师!!!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-7 23:38:16 | 只看该作者 Only view this author
Kmetsch 发表于 2023-6-7 23:25
需要考虑你要用哪种力场,有的力场不支持kokkos加速。如果支持的话,可以上两台7950X+2*4090
另外还有一种 ...

力场应该是用ReaxFF

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发表于 Post on 2023-6-7 23:41:54 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Entropy.S.I 于 2023-6-8 01:50 编辑
Kmetsch 发表于 2023-6-7 23:25
需要考虑你要用哪种力场,有的力场不支持kokkos加速。如果支持的话,可以上两台7950X+2*4090
另外还有一种 ...

7950X只在用不是纯GPU方案的“GPU”包时,或有可能用到不支持GPU加速的pair_style时,才有必要配。

7600X,B650平台,就能搭5块P100,用PCIe拆分就行了,GPU各跑各的Kokkos加速lmp任务时,对CPU-GPU通信需求非常低,PCIe Gen3 x4足够。这种方案也是有现成的机箱的。

当然,5600X配B550也是可以的,只不过目前这套的价格并没有比7600X+B650便宜很多。


让每块卡都获得全速PCIe连接,只有在需要多卡跑单任务是才有必要考虑。此时选择5955WX非常合适,单核性能强、PCIe lane数量多(单路主板可以有6条全速PCIe x16 slot),还能让所有GPU实现最高效的PCIe P2P连接。需要指出的是,5955WX平台并不贵,5955WX+M12SWA+8*32GB DDR4 3200也就1.5万元。
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发表于 Post on 2023-6-7 23:44:39 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Entropy.S.I 于 2023-6-8 02:17 编辑
Sun-2022 发表于 2023-6-7 23:38
力场应该是用ReaxFF

不建议用4090,应该用二手P100、V100 16G或TITAN V,具体请看我上面提到的文章。P100现在价格1000多元;V100 16G和TITAN V现在价格3000~4000元,TITAN V更便宜一些。

V100 16G、TITAN V的性能与V100 PCIe 32G几乎相同,区别只有VRAM大小,这对于MD模拟来说几乎没有影响。看我发的表格,V100 PCIe 32G跑ReaxFF的性能明显强于RTX4090,所以对你们来说性价比极高。

既然已经确认使用ReaxFF,那么专门再买一台纯CPU机是毫无必要的,一块1000多元的P100就能超越数万元的双路CPU机器。如果你对单个模拟的速度要求比较高,应该使用PCIe lane充足的平台,以便使用多卡运行1个模拟,参考上面提到的5955WX + M12SWA + 8*32GB DDR4 3200,这套平台1.5万元,可以配6块V100 16G或TITAN V,就算4000元一片,再算上机箱、电源、2*2TB PCIe4.0 NVMe SSD RAID1以及若干18TB HDD的价格,整套平台最多不超过4.5万。剩下1.5万,能留着就留着。

至于采购方式,找经销商配好整机,不必担心报销的问题。
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