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[GROMACS] 求助gromacs如何获得热容-温度曲线

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各位老师好,我看了一篇使用TraPPe-UA力场模拟聚乙烯结晶过程的文献。文献中有一张比容和热容对温度进行作图的图像,如图。
请问在gromacs中要如何得到这种连续的热容-温度的曲线?gmx energy -fluct_props命令得到的好像是整个过程中热容的平均值?

如果需要在不同的温度下跑NPT然后用这个命令求比热,由于控温过程中温度会有上下几K的波动,我该如何获得对应温度下的热容呢?请各位老师指教,谢谢


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发表于 Post on 2023-6-26 23:10:22 | 只看该作者 Only view this author
写个shell脚本,热浴的参考温度每提升一点就跑一次模拟
图上的温度坐标取MD过程的平均温度
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-27 15:03:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-26 23:10
写个shell脚本,热浴的参考温度每提升一点就跑一次模拟
图上的温度坐标取MD过程的平均温度

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2025-1-22 22:44:04 | 只看该作者 Only view this author
请问楼主看的时那篇文献?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-4 15:10:49 | 只看该作者 Only view this author

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