cp2k跑aimd速度很慢怎么解决

Ninilol · 发表于 Post on 2023-7-15 14:20:07

想用cp2k跑一个含过渡金属Fe体系的aimd，体系是总共60个原子的孤立体系。用的是b3lyp和DZVP-MOLOPT-SR-GTH的赝势基组，在300k的温度下跑的。给这个任务分了32核，但是速度非常慢，42小时才跑了38fs。

所以想请教各位老师，(1)是因为核数设置的有问题吗？可是我试了4，8，12，16，20，32核，整体速度还是32核的 ‘CPU time per MD step ’ 最短。(2)还是输入文件设置的有问题，输入文件和提交任务的脚本都上传到附件了。(3)还是这个体系用b3lyp和DZVP-MOLOPT-SR-GTH的方法基组速度本来就是只有这么快的？
还请各位老师，帮帮忙，看一下问题到底出在什么地方，谢谢啦

Ninilol · 发表于 Post on 2023-7-15 16:09:36

问题已解决，之前一直在纠结输入文件的问题，其实最后是cp2k.popt在脚本里面写成了cp2k.sopt

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