电子密度差图的电荷分布与等值面位置与分子本身有差别

Infaltion · 发表于 Post on 2023-7-20 17:57:12

本帖最后由 Infaltion 于 2023-7-20 17:57 编辑

各位老师好！
我想要用高斯对于电子密度差图进行计算，我首先得到了三个片段分别的波函数，然后我进行电子密度差分析的过程中发现电子密度差等值面的位置和分子的结构位置略有差异。想请教一下各位老师这个如何解决。

如图所示，可以看到PF6离子的周围蓝色区域与PF6的形状十分的类似。但是我在输入文件中又保持了片段中相同原子的坐标一致，不知道该如何解决，恳请各位老师帮助！

输入文件与输出文件如下。3.fchk大小略大，无法上传，可以通过链接：https://pan.baidu.com/s/1TyIfz0yAMgczNvlUfCRCGA
提取码：b64m 进行下载，谢谢各位老师！

sobereva · 发表于 Post on 2023-7-20 19:18:10

你明明用的是Multiwfn按下文画的密度差图，不要说成 “用高斯对于电子密度差图进行计算”
使用Multiwfn作电子密度差图
http://sobereva.com/113

Multiwfn载入波函数文件后进入主功能0，文本窗口直接显示坐标，确保坐标一致。不一致要么gjf文件里的坐标就不一致，要么没写nosymm

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[Gaussian/gview] 电子密度差图的电荷分布与等值面位置与分子本身有差别