计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 514|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[PSI4] PSI4能量分解计算索烃结构621原子出错

[复制链接 Copy URL]

106

帖子

0

威望

321

eV
积分
427

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
计算任务是索烃结构621原子,含W.Cu金属,基组def2-svp,130G内存,50核并行,分两个片段,分别带+1,+4电荷,结构是xtb优化的,还请各位老师的指点,谢谢
输入文件:
memory 130 GB
..........
set {
    scf_type DF
    freeze_core True
    basis def2-svp
}

energy('sapt0')

输出文件出错:
Fatal Error: READ failed. Error description from the OS: Bad address             !
! Error reading the first partial page, unit 97.                                   !
! Error occurred in file: /home/conda/feedstock_root/build_artifacts/psi4_16893433 !
!     50370/work/psi4/src/psi4/libpsio/error.cc on line: 135                       !
! The most recent 5 function calls were:                                           !
! psi::PsiException::PsiException(std::__cxx11::basic_string<char,                 !
!     std::char_traits<char>, std::allocator<char> >, char const*, int)            !
! psi::PSIO::rw(unsigned long, char*, psi::psio_address, unsigned long, int)       !
! psi::DiskDFJK::manage_JK_disk()                                                  !
! psi::DiskDFJK::compute_JK()                                                      !
!                                                                                  !
!----------------------------------------------------------------------------------!

    Psi4 stopped on: Friday, 28 July 2023 09:50PM
    Psi4 wall time for execution: 1:31:55.85

*** Psi4 encountered an error. Buy a developer more coffee!
*** Resources and help at github.com/psi4/psi4.

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112492

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-7-29 12:30:20 | 只看该作者 Only view this author
621原子SAPT就别想了

用sobEDA/sobEDAw做能量分解倒是有戏。只要DFT算得动单点的级别就能做得动sobEDA/sobEDAw。看原文,以及里面提到的教程
Tian Lu, Qinxue Chen, A simple, efficient and universal energy decomposition analysis method based on dispersion-corrected density functional theory
ChemRxiv (2023) DOI: 10.26434/chemrxiv-2023-n79rz
文章已基本被JPCA接收了,最近会写博文专题介绍
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

106

帖子

0

威望

321

eV
积分
427

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-29 14:10:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-7-29 12:30
621原子SAPT就别想了

用sobEDA/sobEDAw做能量分解倒是有戏。只要DFT算得动单点的级别就能做得动sobEDA/s ...

好的,谢谢Sob老师一直来的指导,我认真拜读一下

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 22:37 , Processed in 0.160165 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list