计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 959|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析求助] 引用IRI方法分析分子内弱相互作用遭到审稿人质疑

[复制链接 Copy URL]

39

帖子

0

威望

856

eV
积分
895

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 dahai7719 于 2023-8-10 16:45 编辑

老师您好:我一篇投稿文章引用了老师您2021年Chemistry—Methods 中论文 10.1002/cmtd.202100007中的Fig 1并直接引用了您文章中这句话:The sign(λ2)denotes the sign of the second largest eigenvalue of Hessian of ρ, whichhas a certain ability to distinguish attractive and repulsive interactions来说明我所研究体系中的分子内弱相互作用, 审稿人给出了如下质疑:
    That is erroneous statement, which is often repeated in the literature.Meawhile, the sign(λ2) does not allow to distinguish the attractive and repulsive interactions. If sign(λ2) > 0 , then corresponding bond path (and corresponding bcp) is simply absent. In this point, the acceptedmodel is going beyond the Bader QTAIM theory, therefore the additional arguments are needed for convincing analysis.
    我没有搞清楚审稿人这么说的根据在哪里,我正在看Bader 的QTAIM,感觉短期内很难解决这个问题,还望老师能给解惑!谢谢老师!!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112499

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-8-10 21:06:36 | 只看该作者 Only view this author
审稿人连基本的原理都根本不懂
首先,IRI、IGMH等方法比AIM拓扑分析的关键优势之一就是能把靠AIM拓扑分析无法展现的相互作用展现出来,脱离了BCP、RCP这些概念的束缚、根本就不需要BCP/RCP的存在,这在IRI原文里已经论证得极其清楚了,让审稿人好好看IRI原文,以及下文里我的综述
一篇最全面介绍各种弱相互作用可视化分析方法的文章已发表!
http://sobereva.com/667http://bbs.keinsci.com/thread-37629-1-1.html

这些弱相互作用图形化分析手段根本就不属于QTAIM,居然还拿QTAIM的概念来评价这类方法,非常荒唐。


靠sign(lambda2)rho的颜色来判断相互作用的吸引和互斥,尽管略有经验性,但自从NCI方法在2010年提出后,在几千篇应用文章中已经被学术界广为接受,而且如我的IRI、IGMH原文以及上面提及的综述文章里所展现的巨量实例,都充分体现出靠它来直观体现吸引/互斥是很靠谱的。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

39

帖子

0

威望

856

eV
积分
895

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-10 22:35:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-8-10 21:06
审稿人连基本的原理都根本不懂
首先,IRI、IGMH等方法比AIM拓扑分析的关键优势之一就是能把靠AIM拓扑分析 ...

谢谢老师的点拨,审稿人把我也弄糊涂了,说明还是自己的理论底子薄弱,后面加强消化!!再次感谢老师

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 12:41 , Processed in 0.418236 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list