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[波函数分析求助] 应用IGMH原文方法进行弱相互作用分析时VMD中着色尺度的取值值一致性问题

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本帖最后由 dahai7719 于 2023-8-29 22:41 编辑

老师您好,如果应用IGMH原文中的着色标注图进行分析自己的体系时,在VMD中着色范围必须和原文的标准着色图严格一致(即-0.05,0.05),不得随意改动对么?包括散点图的着色范围也严格一致才可以进行颜色进行对比分析对么?如果体系按照原文的着色范围不改的话出现如图中三色环等值面(最里面蓝,中间有个红色圈,最外层绿色) 这种情况是应该三种对应作用都存在还是着色范围需要调整? 另外如果做了轻微的调整还能否对着标准着色图来进行分析?如果必须保持一致要是调整原文中的着色图的着色范围有没有相应的脚本,谢谢!

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发表于 Post on 2023-8-30 00:09:16 | 只看该作者 Only view this author
不需要一致,随机应变
而且IGMH等值面数值也没有统一的,根据情况恰当修改以得到最好效果
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-30 07:12:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-8-30 00:09
不需要一致,随机应变
而且IGMH等值面数值也没有统一的,根据情况恰当修改以得到最好效果

谢谢老师解答!

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发表于 Post on 2024-6-26 18:21:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-8-30 00:09
不需要一致,随机应变
而且IGMH等值面数值也没有统一的,根据情况恰当修改以得到最好效果

老师您好,着色范围改了之后,有什么方法可以生成colorbar吗?还是说需要根据自己IGMH图里等值面的颜色重新画

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发表于 Post on 2024-6-27 02:52:23 | 只看该作者 Only view this author
wze 发表于 2024-6-26 18:21
老师您好,着色范围改了之后,有什么方法可以生成colorbar吗?还是说需要根据自己IGMH图里等值面的颜色重 ...

颜色过渡方式总是固定的,只需要把colorbar上面两端重新标上新的上下限的值就完了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2024-6-27 19:41:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-6-27 02:52
颜色过渡方式总是固定的,只需要把colorbar上面两端重新标上新的上下限的值就完了

明白了,谢谢老师!

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