计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 2132|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 求助:CP2K几何优化参数是否合适

[复制链接 Copy URL]

165

帖子

0

威望

1219

eV
积分
1384

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 lwang2016 于 2023-9-14 10:42 编辑

求助各位老师

我在进行有机晶体的几何优化,通过multiwfn软件产生输入文件。经过约1小时的计算运行,任务正常结束。

由于是第一次使用CP2K,请问大家几何优化的参数设置是否合理,我是打算接下来进行NMR屏蔽常数的计算的。
K点使用了默认的,没有进行设置。

谢谢大家。

c4ce00012a2.inp

11.74 KB, 下载次数 Times of downloads: 20

multiwfn产生的输入文件

c4ce00012a2.cif

6.92 KB, 下载次数 Times of downloads: 9

cif源文件

out

557.86 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

计算产生的结果文件

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-9-14 18:45:02 | 只看该作者 Only view this author
光给out文件没用,不含结构信息,别人也不知道优化完的结构合理性。至少上传个restart文件,Multiwfn直接就能载入然后在主功能0里观看优化完的结构,或者上传优化产生的轨迹文件

x方向晶胞边长那么短,不考虑k点绝对不行
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

165

帖子

0

威望

1219

eV
积分
1384

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-14 20:10:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-14 18:45
光给out文件没用,不含结构信息,别人也不知道优化完的结构合理性。至少上传个restart文件,Multiwfn直接就 ...

您好 卢老师,感谢回复。

重新上传了附件。谢谢。轨迹文件提示无法上传。

另外,请问在输入文件中应该如何设置K点,填入的K点信息是如何获取的?

c4ce00012a2-1.restart

15.76 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2023-9-14 20:32:35 | 只看该作者 Only view this author
lwang2016 发表于 2023-9-14 20:10
您好 卢老师,感谢回复。

重新上传了附件。谢谢。轨迹文件提示无法上传。

诸如此类必知必会的知识在北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)里都有全面讲解






xyz轨迹不压缩导致尺寸超标自然没法上传
计算化学研究者应当了解的文件压缩的常识
http://sobereva.com/672http://bbs.keinsci.com/thread-37881-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

165

帖子

0

威望

1219

eV
积分
1384

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-14 20:41:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-14 20:32
诸如此类必知必会的知识在北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_cont ...

算出来
10/3.8669=2.586       10/16.6497=0.6       10/21.7468=0.46

K取 3 1 1

请问卢老师是否合适呀

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2023-9-14 21:16:37 | 只看该作者 Only view this author
lwang2016 发表于 2023-9-14 20:41
算出来
10/3.8669=2.586       10/16.6497=0.6       10/21.7468=0.46

可以
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

165

帖子

0

威望

1219

eV
积分
1384

Level 4 (黑子)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-14 21:23:54 | 只看该作者 Only view this author

多谢卢老师。

165

帖子

0

威望

1219

eV
积分
1384

Level 4 (黑子)

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-14 21:41:43 | 只看该作者 Only view this author

您好 卢老师

使用K点 5 1 1重新进行了计算,麻烦您看一下 几何优化是否合适。

谢谢。

c4ce00012a2-1 (1).restart

15.83 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

c4ce00012a2x (1).inp

11.9 KB, 下载次数 Times of downloads: 17

out

292.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

c4ce00012a2-pos-1 (1).xyz.zip

180.99 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

9#
发表于 Post on 2023-9-14 22:39:27 | 只看该作者 Only view this author
lwang2016 发表于 2023-9-14 21:41
您好 卢老师

使用K点 5 1 1重新进行了计算,麻烦您看一下 几何优化是否合适。

没明显问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-21 14:25 , Processed in 0.176029 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list