计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 9795|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析求助] 求助做静电势图

[复制链接 Copy URL]

28

帖子

0

威望

305

eV
积分
333

Level 3 能力者

老师您好!请问这样的静电势图具体怎么做。既包括分子不同平面的静电势图,也有密度差分的静电势填色图。

ps:该图取自附件中的文献

静电势图.png (155.85 KB, 下载次数 Times of downloads: 54)

静电势图.png

Electronic Polarization in Organic Crystals A Comparative Study of.pdf

2.78 MB, 下载次数 Times of downloads: 33

3097

帖子

29

威望

1万

eV
积分
17094

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2016-9-7 16:22:34 | 只看该作者 Only view this author
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布
http://sobereva.com/196
使用Multiwfn做电子密度、ELF、静电势、密度差等函数的盆分析
http://sobereva.com/179
在GaussView里绘制分子表面静电势填色图的过程
http://sobereva.com/253

想不出来“电子密度差的静电势填色图”是什么含义。。。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +1 收起 理由
Reason
sobereva + 1

查看全部评分 View all ratings

28

帖子

0

威望

305

eV
积分
333

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-7 17:46:11 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-9-7 16:22
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布
http://sobereva.com/196
使用Multiwfn做电子密度、EL ...

谢谢老师,就是两种计算形式下得出来的电子密度差

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120081

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2016-9-7 23:48:07 | 只看该作者 Only view this author
看Multiwfn手册4.4节,一堆作平面图的例子,包括静电势的

密度差:
使用Multiwfn作电子密度差图
http://sobereva.com/113
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

28

帖子

0

威望

305

eV
积分
333

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-13 14:49:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-7 23:48
看Multiwfn手册4.4节,一堆作平面图的例子,包括静电势的

密度差:

请问sob老师我做到了这一步,在multiwfn中画出萘分子的xy平面的静电势,接下里怎样改它的颜色呢?让它仅显示红白蓝三种颜色。

DISLIN_1.PNG (116.94 KB, 下载次数 Times of downloads: 31)

静电势平面图

静电势平面图

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120081

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2016-9-13 19:22:11 | 只看该作者 Only view this author
浤羽 发表于 2016-9-13 14:49
请问sob老师我做到了这一步,在multiwfn中画出萘分子的xy平面的静电势,接下里怎样改它的颜色呢?让它仅 ...

色彩只能是 黑(超过下限时)-蓝-绿-红-白(超过上限时)方式变化。用其它色彩变化方式需要用第三方绘制平面图的程序,考虑gnuplot、surfer、matlab等
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

28

帖子

0

威望

305

eV
积分
333

Level 3 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-13 21:07:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-13 19:22
色彩只能是 黑(超过下限时)-蓝-绿-红-白(超过上限时)方式变化。用其它色彩变化方式需要用第三方绘制 ...

谢谢sob老师!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-13 05:20 , Processed in 0.198713 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list